Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms