Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms