Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RORCP51449 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RORCP51449 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RORCP51449 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RORCP51449 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RORCP51449 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RORCP51449 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RORCP51449 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RORCP51449 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RORCP51449 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RORCP51449 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RORCP51449 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RORCP51449 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RORCP51449 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RORCP51449 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RORCP51449 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RORCP51449 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RORCP51449 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RORCP51449 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RORCP51449 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RORCP51449 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RORCP51449 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RORCP51449 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RORCP51449 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RORCP51449 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RORCP51449 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RORCP51449 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RORCP51449 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RORCP51449 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RORCP51449 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RORCP51449 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RORCP51449 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RORCP51449 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RORCP51449 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RORCP51449 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RORCP51449 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RORCP51449 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RORCP51449 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RORCP51449 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RORCP51449 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RORCP51449 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RORCP51449 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RORCP51449 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RORCP51449 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms