Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms