Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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