Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms