Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB2P29033 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB2P29033 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB2P29033 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB2P29033 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB2P29033 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB2P29033 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB2P29033 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB2P29033 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB2P29033 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB2P29033 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB2P29033 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB2P29033 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB2P29033 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB2P29033 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB2P29033 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB2P29033 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB2P29033 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB2P29033 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB2P29033 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB2P29033 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB2P29033 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB2P29033 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB2P29033 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB2P29033 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB2P29033 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB2P29033 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB2P29033 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB2P29033 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB2P29033 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB2P29033 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB2P29033 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB2P29033 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB2P29033 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB2P29033 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB2P29033 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB2P29033 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB2P29033 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB2P29033 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB2P29033 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB2P29033 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB2P29033 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB2P29033 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB2P29033 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB2P29033 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB2P29033 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB2P29033 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB2P29033 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB2P29033 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB2P29033 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB2P29033 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB2P29033 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB2P29033 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB2P29033 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB2P29033 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB2P29033 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB2P29033 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB2P29033 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB2P29033 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB2P29033 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB2P29033 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB2P29033 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB2P29033 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB2P29033 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB2P29033 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB2P29033 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB2P29033 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB2P29033 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB2P29033 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB2P29033 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB2P29033 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB2P29033 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB2P29033 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms