Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT15P19012 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT15P19012 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT15P19012 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT15P19012 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT15P19012 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT15P19012 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT15P19012 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT15P19012 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT15P19012 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT15P19012 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT15P19012 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT15P19012 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT15P19012 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT15P19012 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT15P19012 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT15P19012 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT15P19012 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT15P19012 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT15P19012 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT15P19012 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT15P19012 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT15P19012 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT15P19012 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT15P19012 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT15P19012 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT15P19012 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT15P19012 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT15P19012 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT15P19012 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT15P19012 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT15P19012 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT15P19012 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT15P19012 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT15P19012 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT15P19012 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT15P19012 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT15P19012 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT15P19012 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT15P19012 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT15P19012 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT15P19012 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT15P19012 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT15P19012 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT15P19012 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT15P19012 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT15P19012 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT15P19012 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT15P19012 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT15P19012 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT15P19012 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT15P19012 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT15P19012 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT15P19012 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT15P19012 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT15P19012 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT15P19012 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT15P19012 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT15P19012 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT15P19012 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT15P19012 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT15P19012 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT15P19012 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT15P19012 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT15P19012 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT15P19012 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT15P19012 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT15P19012 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT15P19012 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT15P19012 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT15P19012 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT15P19012 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT15P19012 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT15P19012 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT15P19012 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT15P19012 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT15P19012 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT15P19012 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT15P19012 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT15P19012 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT15P19012 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT15P19012 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT15P19012 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms