Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms