Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms