Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLXND1Q9Y4D7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLXND1Q9Y4D7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLXND1Q9Y4D7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLXND1Q9Y4D7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLXND1Q9Y4D7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PLXND1Q9Y4D7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLXND1Q9Y4D7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PLXND1Q9Y4D7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLXND1Q9Y4D7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLXND1Q9Y4D7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLXND1Q9Y4D7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLXND1Q9Y4D7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PLXND1Q9Y4D7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PLXND1Q9Y4D7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXND1Q9Y4D7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXND1Q9Y4D7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXND1Q9Y4D7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXND1Q9Y4D7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLXND1Q9Y4D7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLXND1Q9Y4D7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLXND1Q9Y4D7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLXND1Q9Y4D7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLXND1Q9Y4D7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PLXND1Q9Y4D7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLXND1Q9Y4D7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLXND1Q9Y4D7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLXND1Q9Y4D7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLXND1Q9Y4D7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLXND1Q9Y4D7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLXND1Q9Y4D7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLXND1Q9Y4D7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXND1Q9Y4D7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXND1Q9Y4D7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXND1Q9Y4D7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXND1Q9Y4D7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXND1Q9Y4D7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLXND1Q9Y4D7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLXND1Q9Y4D7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXND1Q9Y4D7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXND1Q9Y4D7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXND1Q9Y4D7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXND1Q9Y4D7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLXND1Q9Y4D7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXND1Q9Y4D7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXND1Q9Y4D7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.76
PLXND1Q9Y4D7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PLXND1Q9Y4D7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXND1Q9Y4D7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXND1Q9Y4D7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXND1Q9Y4D7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PLXND1Q9Y4D7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLXND1Q9Y4D7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXND1Q9Y4D7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXND1Q9Y4D7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXND1Q9Y4D7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXND1Q9Y4D7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXND1Q9Y4D7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLXND1Q9Y4D7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLXND1Q9Y4D7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLXND1Q9Y4D7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLXND1Q9Y4D7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXND1Q9Y4D7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXND1Q9Y4D7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXND1Q9Y4D7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.9 ms