Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Q9Y3F1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Q9Y3F1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Q9Y3F1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Q9Y3F1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Q9Y3F1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Q9Y3F1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Q9Y3F1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Q9Y3F1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Q9Y3F1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Q9Y3F1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Q9Y3F1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Q9Y3F1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Q9Y3F1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Q9Y3F1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Q9Y3F1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Q9Y3F1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Q9Y3F1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Q9Y3F1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q9Y3F1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Q9Y3F1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Q9Y3F1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Q9Y3F1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Q9Y3F1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Q9Y3F1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q9Y3F1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Q9Y3F1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Q9Y3F1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q9Y3F1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q9Y3F1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q9Y3F1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q9Y3F1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Q9Y3F1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Q9Y3F1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Q9Y3F1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Q9Y3F1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Q9Y3F1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Q9Y3F1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Q9Y3F1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Q9Y3F1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Q9Y3F1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Q9Y3F1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Q9Y3F1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Q9Y3F1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Q9Y3F1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Q9Y3F1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Q9Y3F1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Q9Y3F1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Q9Y3F1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Q9Y3F1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Q9Y3F1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Q9Y3F1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Q9Y3F1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Q9Y3F1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Q9Y3F1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Q9Y3F1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Q9Y3F1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Q9Y3F1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Q9Y3F1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Q9Y3F1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Q9Y3F1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Q9Y3F1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Q9Y3F1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Q9Y3F1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Q9Y3F1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Q9Y3F1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Q9Y3F1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Q9Y3F1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Q9Y3F1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Q9Y3F1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Q9Y3F1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Q9Y3F1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Q9Y3F1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Q9Y3F1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Q9Y3F1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Q9Y3F1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Q9Y3F1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Q9Y3F1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Q9Y3F1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Q9Y3F1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Q9Y3F1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Q9Y3F1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Q9Y3F1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Q9Y3F1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Q9Y3F1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Q9Y3F1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Q9Y3F1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Q9Y3F1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Q9Y3F1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Q9Y3F1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Q9Y3F1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Q9Y3F1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Q9Y3F1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Q9Y3F1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Q9Y3F1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Q9Y3F1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Q9Y3F1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Q9Y3F1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Q9Y3F1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Q9Y3F1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms