Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL20Q9Y2M5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL20Q9Y2M5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL20Q9Y2M5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL20Q9Y2M5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL20Q9Y2M5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL20Q9Y2M5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL20Q9Y2M5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL20Q9Y2M5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL20Q9Y2M5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL20Q9Y2M5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL20Q9Y2M5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL20Q9Y2M5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL20Q9Y2M5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL20Q9Y2M5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL20Q9Y2M5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL20Q9Y2M5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL20Q9Y2M5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL20Q9Y2M5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL20Q9Y2M5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL20Q9Y2M5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL20Q9Y2M5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL20Q9Y2M5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL20Q9Y2M5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL20Q9Y2M5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL20Q9Y2M5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL20Q9Y2M5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL20Q9Y2M5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL20Q9Y2M5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL20Q9Y2M5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL20Q9Y2M5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL20Q9Y2M5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL20Q9Y2M5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL20Q9Y2M5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL20Q9Y2M5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL20Q9Y2M5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL20Q9Y2M5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL20Q9Y2M5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL20Q9Y2M5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL20Q9Y2M5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL20Q9Y2M5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL20Q9Y2M5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL20Q9Y2M5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL20Q9Y2M5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL20Q9Y2M5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL20Q9Y2M5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL20Q9Y2M5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL20Q9Y2M5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL20Q9Y2M5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL20Q9Y2M5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL20Q9Y2M5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL20Q9Y2M5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL20Q9Y2M5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KLHL20Q9Y2M5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL20Q9Y2M5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL20Q9Y2M5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL20Q9Y2M5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL20Q9Y2M5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL20Q9Y2M5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL20Q9Y2M5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL20Q9Y2M5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL20Q9Y2M5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL20Q9Y2M5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL20Q9Y2M5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL20Q9Y2M5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL20Q9Y2M5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL20Q9Y2M5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL20Q9Y2M5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL20Q9Y2M5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL20Q9Y2M5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL20Q9Y2M5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL20Q9Y2M5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL20Q9Y2M5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL20Q9Y2M5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL20Q9Y2M5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL20Q9Y2M5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL20Q9Y2M5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL20Q9Y2M5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL20Q9Y2M5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms