Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
NINLQ9Y2I6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
NINLQ9Y2I6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
NINLQ9Y2I6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
NINLQ9Y2I6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
NINLQ9Y2I6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NINLQ9Y2I6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NINLQ9Y2I6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NINLQ9Y2I6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NINLQ9Y2I6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NINLQ9Y2I6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NINLQ9Y2I6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NINLQ9Y2I6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NINLQ9Y2I6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NINLQ9Y2I6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NINLQ9Y2I6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NINLQ9Y2I6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NINLQ9Y2I6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NINLQ9Y2I6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NINLQ9Y2I6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NINLQ9Y2I6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NINLQ9Y2I6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NINLQ9Y2I6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NINLQ9Y2I6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NINLQ9Y2I6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NINLQ9Y2I6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
NINLQ9Y2I6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NINLQ9Y2I6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NINLQ9Y2I6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NINLQ9Y2I6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NINLQ9Y2I6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NINLQ9Y2I6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NINLQ9Y2I6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
NINLQ9Y2I6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NINLQ9Y2I6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NINLQ9Y2I6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NINLQ9Y2I6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NINLQ9Y2I6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NINLQ9Y2I6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NINLQ9Y2I6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NINLQ9Y2I6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NINLQ9Y2I6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NINLQ9Y2I6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NINLQ9Y2I6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
NINLQ9Y2I6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
NINLQ9Y2I6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NINLQ9Y2I6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NINLQ9Y2I6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
NINLQ9Y2I6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NINLQ9Y2I6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NINLQ9Y2I6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NINLQ9Y2I6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NINLQ9Y2I6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NINLQ9Y2I6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
NINLQ9Y2I6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
NINLQ9Y2I6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NINLQ9Y2I6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NINLQ9Y2I6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NINLQ9Y2I6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NINLQ9Y2I6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NINLQ9Y2I6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NINLQ9Y2I6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NINLQ9Y2I6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NINLQ9Y2I6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
NINLQ9Y2I6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NINLQ9Y2I6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NINLQ9Y2I6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NINLQ9Y2I6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NINLQ9Y2I6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NINLQ9Y2I6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
NINLQ9Y2I6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NINLQ9Y2I6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NINLQ9Y2I6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NINLQ9Y2I6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NINLQ9Y2I6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NINLQ9Y2I6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NINLQ9Y2I6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NINLQ9Y2I6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NINLQ9Y2I6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NINLQ9Y2I6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NINLQ9Y2I6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NINLQ9Y2I6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
NINLQ9Y2I6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NINLQ9Y2I6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NINLQ9Y2I6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NINLQ9Y2I6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NINLQ9Y2I6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NINLQ9Y2I6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NINLQ9Y2I6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NINLQ9Y2I6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NINLQ9Y2I6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NINLQ9Y2I6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NINLQ9Y2I6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NINLQ9Y2I6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NINLQ9Y2I6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NINLQ9Y2I6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NINLQ9Y2I6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NINLQ9Y2I6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
NINLQ9Y2I6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
NINLQ9Y2I6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms