Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ53

MGAT4B, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase B, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4BQ9UQ53 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MGAT4BQ9UQ53 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MGAT4BQ9UQ53 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MGAT4BQ9UQ53 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MGAT4BQ9UQ53 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MGAT4BQ9UQ53 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MGAT4BQ9UQ53 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MGAT4BQ9UQ53 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MGAT4BQ9UQ53 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MGAT4BQ9UQ53 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MGAT4BQ9UQ53 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MGAT4BQ9UQ53 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MGAT4BQ9UQ53 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MGAT4BQ9UQ53 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MGAT4BQ9UQ53 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MGAT4BQ9UQ53 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MGAT4BQ9UQ53 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MGAT4BQ9UQ53 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MGAT4BQ9UQ53 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MGAT4BQ9UQ53 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MGAT4BQ9UQ53 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MGAT4BQ9UQ53 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MGAT4BQ9UQ53 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MGAT4BQ9UQ53 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MGAT4BQ9UQ53 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MGAT4BQ9UQ53 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MGAT4BQ9UQ53 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MGAT4BQ9UQ53 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MGAT4BQ9UQ53 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MGAT4BQ9UQ53 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MGAT4BQ9UQ53 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MGAT4BQ9UQ53 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MGAT4BQ9UQ53 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MGAT4BQ9UQ53 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MGAT4BQ9UQ53 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MGAT4BQ9UQ53 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MGAT4BQ9UQ53 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MGAT4BQ9UQ53 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MGAT4BQ9UQ53 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MGAT4BQ9UQ53 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MGAT4BQ9UQ53 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MGAT4BQ9UQ53 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MGAT4BQ9UQ53 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MGAT4BQ9UQ53 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MGAT4BQ9UQ53 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MGAT4BQ9UQ53 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MGAT4BQ9UQ53 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MGAT4BQ9UQ53 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MGAT4BQ9UQ53 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MGAT4BQ9UQ53 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MGAT4BQ9UQ53 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MGAT4BQ9UQ53 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MGAT4BQ9UQ53 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MGAT4BQ9UQ53 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MGAT4BQ9UQ53 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MGAT4BQ9UQ53 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MGAT4BQ9UQ53 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MGAT4BQ9UQ53 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MGAT4BQ9UQ53 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MGAT4BQ9UQ53 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MGAT4BQ9UQ53 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MGAT4BQ9UQ53 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MGAT4BQ9UQ53 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MGAT4BQ9UQ53 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MGAT4BQ9UQ53 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MGAT4BQ9UQ53 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MGAT4BQ9UQ53 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MGAT4BQ9UQ53 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MGAT4BQ9UQ53 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MGAT4BQ9UQ53 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MGAT4BQ9UQ53 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms