Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX7Q9UNH6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX7Q9UNH6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX7Q9UNH6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX7Q9UNH6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX7Q9UNH6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX7Q9UNH6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX7Q9UNH6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX7Q9UNH6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX7Q9UNH6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX7Q9UNH6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX7Q9UNH6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX7Q9UNH6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX7Q9UNH6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX7Q9UNH6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX7Q9UNH6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX7Q9UNH6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX7Q9UNH6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX7Q9UNH6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX7Q9UNH6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX7Q9UNH6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX7Q9UNH6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX7Q9UNH6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX7Q9UNH6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX7Q9UNH6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX7Q9UNH6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX7Q9UNH6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX7Q9UNH6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX7Q9UNH6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX7Q9UNH6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX7Q9UNH6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX7Q9UNH6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX7Q9UNH6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX7Q9UNH6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX7Q9UNH6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX7Q9UNH6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX7Q9UNH6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX7Q9UNH6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX7Q9UNH6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX7Q9UNH6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX7Q9UNH6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX7Q9UNH6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX7Q9UNH6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX7Q9UNH6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX7Q9UNH6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX7Q9UNH6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX7Q9UNH6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX7Q9UNH6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX7Q9UNH6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX7Q9UNH6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX7Q9UNH6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX7Q9UNH6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX7Q9UNH6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX7Q9UNH6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX7Q9UNH6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX7Q9UNH6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX7Q9UNH6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX7Q9UNH6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX7Q9UNH6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX7Q9UNH6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX7Q9UNH6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX7Q9UNH6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX7Q9UNH6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX7Q9UNH6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX7Q9UNH6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX7Q9UNH6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX7Q9UNH6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX7Q9UNH6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX7Q9UNH6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX7Q9UNH6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX7Q9UNH6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX7Q9UNH6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX7Q9UNH6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX7Q9UNH6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX7Q9UNH6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX7Q9UNH6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX7Q9UNH6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX7Q9UNH6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX7Q9UNH6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX7Q9UNH6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX7Q9UNH6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX7Q9UNH6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX7Q9UNH6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX7Q9UNH6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX7Q9UNH6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX7Q9UNH6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX7Q9UNH6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX7Q9UNH6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX7Q9UNH6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX7Q9UNH6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SNX7Q9UNH6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX7Q9UNH6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX7Q9UNH6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX7Q9UNH6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX7Q9UNH6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX7Q9UNH6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX7Q9UNH6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX7Q9UNH6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX7Q9UNH6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX7Q9UNH6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms