Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCTN4Q9UJW0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCTN4Q9UJW0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCTN4Q9UJW0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCTN4Q9UJW0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCTN4Q9UJW0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCTN4Q9UJW0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCTN4Q9UJW0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DCTN4Q9UJW0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCTN4Q9UJW0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCTN4Q9UJW0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCTN4Q9UJW0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCTN4Q9UJW0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCTN4Q9UJW0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCTN4Q9UJW0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCTN4Q9UJW0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCTN4Q9UJW0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCTN4Q9UJW0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCTN4Q9UJW0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCTN4Q9UJW0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCTN4Q9UJW0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCTN4Q9UJW0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCTN4Q9UJW0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCTN4Q9UJW0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCTN4Q9UJW0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCTN4Q9UJW0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCTN4Q9UJW0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCTN4Q9UJW0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCTN4Q9UJW0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCTN4Q9UJW0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCTN4Q9UJW0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCTN4Q9UJW0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCTN4Q9UJW0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCTN4Q9UJW0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCTN4Q9UJW0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DCTN4Q9UJW0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCTN4Q9UJW0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCTN4Q9UJW0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DCTN4Q9UJW0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCTN4Q9UJW0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCTN4Q9UJW0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DCTN4Q9UJW0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCTN4Q9UJW0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCTN4Q9UJW0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCTN4Q9UJW0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCTN4Q9UJW0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DCTN4Q9UJW0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCTN4Q9UJW0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCTN4Q9UJW0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCTN4Q9UJW0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCTN4Q9UJW0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCTN4Q9UJW0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCTN4Q9UJW0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCTN4Q9UJW0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCTN4Q9UJW0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCTN4Q9UJW0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCTN4Q9UJW0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCTN4Q9UJW0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCTN4Q9UJW0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCTN4Q9UJW0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCTN4Q9UJW0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCTN4Q9UJW0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCTN4Q9UJW0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCTN4Q9UJW0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCTN4Q9UJW0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCTN4Q9UJW0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCTN4Q9UJW0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms