Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD3Q9UJU5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD3Q9UJU5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD3Q9UJU5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD3Q9UJU5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD3Q9UJU5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD3Q9UJU5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD3Q9UJU5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD3Q9UJU5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD3Q9UJU5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD3Q9UJU5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD3Q9UJU5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD3Q9UJU5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD3Q9UJU5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD3Q9UJU5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD3Q9UJU5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD3Q9UJU5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD3Q9UJU5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD3Q9UJU5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD3Q9UJU5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD3Q9UJU5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD3Q9UJU5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD3Q9UJU5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD3Q9UJU5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD3Q9UJU5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD3Q9UJU5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD3Q9UJU5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD3Q9UJU5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD3Q9UJU5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD3Q9UJU5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD3Q9UJU5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD3Q9UJU5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD3Q9UJU5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD3Q9UJU5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD3Q9UJU5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD3Q9UJU5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD3Q9UJU5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD3Q9UJU5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD3Q9UJU5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD3Q9UJU5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD3Q9UJU5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD3Q9UJU5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD3Q9UJU5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD3Q9UJU5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD3Q9UJU5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD3Q9UJU5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD3Q9UJU5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD3Q9UJU5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD3Q9UJU5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXD3Q9UJU5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXD3Q9UJU5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms