Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAX2Q9UIW0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAX2Q9UIW0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAX2Q9UIW0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAX2Q9UIW0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAX2Q9UIW0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAX2Q9UIW0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAX2Q9UIW0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAX2Q9UIW0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAX2Q9UIW0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAX2Q9UIW0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAX2Q9UIW0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAX2Q9UIW0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAX2Q9UIW0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAX2Q9UIW0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAX2Q9UIW0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAX2Q9UIW0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAX2Q9UIW0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAX2Q9UIW0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAX2Q9UIW0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAX2Q9UIW0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAX2Q9UIW0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAX2Q9UIW0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAX2Q9UIW0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAX2Q9UIW0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAX2Q9UIW0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAX2Q9UIW0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAX2Q9UIW0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms