Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC24A2Q9UI40 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC24A2Q9UI40 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC24A2Q9UI40 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC24A2Q9UI40 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC24A2Q9UI40 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC24A2Q9UI40 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC24A2Q9UI40 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC24A2Q9UI40 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC24A2Q9UI40 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC24A2Q9UI40 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC24A2Q9UI40 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC24A2Q9UI40 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC24A2Q9UI40 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC24A2Q9UI40 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC24A2Q9UI40 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC24A2Q9UI40 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC24A2Q9UI40 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC24A2Q9UI40 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC24A2Q9UI40 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC24A2Q9UI40 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC24A2Q9UI40 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC24A2Q9UI40 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC24A2Q9UI40 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC24A2Q9UI40 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC24A2Q9UI40 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC24A2Q9UI40 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC24A2Q9UI40 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC24A2Q9UI40 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC24A2Q9UI40 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC24A2Q9UI40 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC24A2Q9UI40 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC24A2Q9UI40 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC24A2Q9UI40 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC24A2Q9UI40 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC24A2Q9UI40 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC24A2Q9UI40 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC24A2Q9UI40 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC24A2Q9UI40 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC24A2Q9UI40 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC24A2Q9UI40 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC24A2Q9UI40 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC24A2Q9UI40 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC24A2Q9UI40 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC24A2Q9UI40 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC24A2Q9UI40 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC24A2Q9UI40 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC24A2Q9UI40 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC24A2Q9UI40 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC24A2Q9UI40 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC24A2Q9UI40 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC24A2Q9UI40 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC24A2Q9UI40 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC24A2Q9UI40 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC24A2Q9UI40 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC24A2Q9UI40 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC24A2Q9UI40 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC24A2Q9UI40 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC24A2Q9UI40 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC24A2Q9UI40 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC24A2Q9UI40 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC24A2Q9UI40 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC24A2Q9UI40 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC24A2Q9UI40 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC24A2Q9UI40 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC24A2Q9UI40 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC24A2Q9UI40 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC24A2Q9UI40 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC24A2Q9UI40 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC24A2Q9UI40 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC24A2Q9UI40 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC24A2Q9UI40 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC24A2Q9UI40 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms