Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF8

PI4KB, Phosphatidylinositol 4-kinase beta, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KBQ9UBF8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PI4KBQ9UBF8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PI4KBQ9UBF8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PI4KBQ9UBF8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PI4KBQ9UBF8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PI4KBQ9UBF8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PI4KBQ9UBF8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PI4KBQ9UBF8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PI4KBQ9UBF8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PI4KBQ9UBF8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PI4KBQ9UBF8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PI4KBQ9UBF8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PI4KBQ9UBF8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PI4KBQ9UBF8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PI4KBQ9UBF8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PI4KBQ9UBF8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PI4KBQ9UBF8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PI4KBQ9UBF8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PI4KBQ9UBF8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PI4KBQ9UBF8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PI4KBQ9UBF8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PI4KBQ9UBF8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PI4KBQ9UBF8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PI4KBQ9UBF8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PI4KBQ9UBF8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PI4KBQ9UBF8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PI4KBQ9UBF8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PI4KBQ9UBF8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PI4KBQ9UBF8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PI4KBQ9UBF8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PI4KBQ9UBF8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PI4KBQ9UBF8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PI4KBQ9UBF8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PI4KBQ9UBF8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PI4KBQ9UBF8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PI4KBQ9UBF8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PI4KBQ9UBF8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PI4KBQ9UBF8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PI4KBQ9UBF8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PI4KBQ9UBF8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PI4KBQ9UBF8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PI4KBQ9UBF8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PI4KBQ9UBF8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
PI4KBQ9UBF8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PI4KBQ9UBF8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PI4KBQ9UBF8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PI4KBQ9UBF8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PI4KBQ9UBF8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PI4KBQ9UBF8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PI4KBQ9UBF8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PI4KBQ9UBF8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PI4KBQ9UBF8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PI4KBQ9UBF8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PI4KBQ9UBF8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
PI4KBQ9UBF8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PI4KBQ9UBF8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PI4KBQ9UBF8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PI4KBQ9UBF8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PI4KBQ9UBF8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PI4KBQ9UBF8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PI4KBQ9UBF8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PI4KBQ9UBF8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PI4KBQ9UBF8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PI4KBQ9UBF8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PI4KBQ9UBF8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PI4KBQ9UBF8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PI4KBQ9UBF8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PI4KBQ9UBF8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PI4KBQ9UBF8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PI4KBQ9UBF8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PI4KBQ9UBF8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PI4KBQ9UBF8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PI4KBQ9UBF8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PI4KBQ9UBF8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
PI4KBQ9UBF8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PI4KBQ9UBF8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PI4KBQ9UBF8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PI4KBQ9UBF8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PI4KBQ9UBF8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PI4KBQ9UBF8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PI4KBQ9UBF8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PI4KBQ9UBF8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PI4KBQ9UBF8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PI4KBQ9UBF8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PI4KBQ9UBF8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PI4KBQ9UBF8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PI4KBQ9UBF8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PI4KBQ9UBF8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PI4KBQ9UBF8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PI4KBQ9UBF8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PI4KBQ9UBF8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PI4KBQ9UBF8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PI4KBQ9UBF8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PI4KBQ9UBF8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PI4KBQ9UBF8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PI4KBQ9UBF8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PI4KBQ9UBF8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PI4KBQ9UBF8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PI4KBQ9UBF8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PI4KBQ9UBF8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms