Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
DNMT3BQ9UBC3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNMT3BQ9UBC3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNMT3BQ9UBC3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNMT3BQ9UBC3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNMT3BQ9UBC3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNMT3BQ9UBC3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNMT3BQ9UBC3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DNMT3BQ9UBC3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNMT3BQ9UBC3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNMT3BQ9UBC3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNMT3BQ9UBC3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNMT3BQ9UBC3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNMT3BQ9UBC3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNMT3BQ9UBC3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNMT3BQ9UBC3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNMT3BQ9UBC3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNMT3BQ9UBC3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNMT3BQ9UBC3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNMT3BQ9UBC3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNMT3BQ9UBC3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNMT3BQ9UBC3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNMT3BQ9UBC3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT3BQ9UBC3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT3BQ9UBC3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNMT3BQ9UBC3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNMT3BQ9UBC3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNMT3BQ9UBC3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNMT3BQ9UBC3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNMT3BQ9UBC3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNMT3BQ9UBC3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNMT3BQ9UBC3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNMT3BQ9UBC3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNMT3BQ9UBC3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNMT3BQ9UBC3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT3BQ9UBC3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT3BQ9UBC3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DNMT3BQ9UBC3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT3BQ9UBC3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT3BQ9UBC3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT3BQ9UBC3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT3BQ9UBC3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT3BQ9UBC3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT3BQ9UBC3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT3BQ9UBC3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT3BQ9UBC3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT3BQ9UBC3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DNMT3BQ9UBC3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DNMT3BQ9UBC3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DNMT3BQ9UBC3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DNMT3BQ9UBC3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
DNMT3BQ9UBC3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT3BQ9UBC3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNMT3BQ9UBC3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNMT3BQ9UBC3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
DNMT3BQ9UBC3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNMT3BQ9UBC3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNMT3BQ9UBC3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNMT3BQ9UBC3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNMT3BQ9UBC3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT3BQ9UBC3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT3BQ9UBC3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT3BQ9UBC3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT3BQ9UBC3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT3BQ9UBC3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT3BQ9UBC3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT3BQ9UBC3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNMT3BQ9UBC3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNMT3BQ9UBC3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNMT3BQ9UBC3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
DNMT3BQ9UBC3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNMT3BQ9UBC3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT3BQ9UBC3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms