Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI8

IGF2BP1, Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGF2BP1Q9NZI8 GTF2A2-207ENST00000480768 1278 ntTSL 215.48■□□□□ 0.072e-20■■■■■ 36.5
IGF2BP1Q9NZI8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.312e-9■■■■■ 36.4
IGF2BP1Q9NZI8 DCTN4-203ENST00000447998 4208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.892e-7■■■■■ 36.4
IGF2BP1Q9NZI8 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.552e-7■■■■■ 36.4
IGF2BP1Q9NZI8 GTF2A1-201ENST00000298173 1677 ntTSL 224.75■■□□□ 1.555e-7■■■■■ 36.4
IGF2BP1Q9NZI8 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.315e-7■■■■■ 36.4
IGF2BP1Q9NZI8 MKRN1-209ENST00000475010 3467 ntTSL 214.04□□□□□ -0.166e-7■■■■■ 36.4
IGF2BP1Q9NZI8 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.196e-7■■■■■ 36.4
IGF2BP1Q9NZI8 C7orf50-204ENST00000412051 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 220.65■□□□□ 0.96e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 C7orf50-205ENST00000444428 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.25■□□□□ 0.036e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.196e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.296e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.466e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 DOCK8-201ENST00000382329 6124 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.566e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.656e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 HECTD4-213ENST00000550968 2313 ntTSL 210.81□□□□□ -0.686e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 CCDC88A-202ENST00000336838 9505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.756e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 DOCK8-205ENST00000453981 7237 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -16e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.16e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 DOCK8-207ENST00000462618 428 ntTSL 37.94□□□□□ -1.146e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 DOCK8-216ENST00000495184 9277 ntTSL 1 (best)7.86□□□□□ -1.156e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM126B-201ENST00000358867 989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.166e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM126B-202ENST00000393375 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.226e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 CDK6-203ENST00000467166 779 ntTSL 27.19□□□□□ -1.269e-21■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM126B-205ENST00000529197 1149 ntTSL 1 (best)6.55□□□□□ -1.366e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.396e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.426e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 CCDC88A-203ENST00000412148 2880 ntTSL 1 (best)5.67□□□□□ -1.56e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM126B-203ENST00000526822 853 ntTSL 25.56□□□□□ -1.526e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 CCDC88A-208ENST00000444458 4236 ntTSL 22.5□□□□□ -2.016e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 EIF3E-215ENST00000522445 841 ntTSL 37.87□□□□□ -1.153e-9■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.253e-11■■■■■ 36.2
IGF2BP1Q9NZI8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.173e-11■■■■■ 36.2
IGF2BP1Q9NZI8 NIPSNAP2-211ENST00000497279 4255 ntTSL 24.75□□□□□ -1.653e-11■■■■■ 36.2
IGF2BP1Q9NZI8 MDC1-207ENST00000492462 819 ntTSL 311.59□□□□□ -0.551e-11■■■■■ 36.1
IGF2BP1Q9NZI8 MSL2-205ENST00000491050 559 ntTSL 47.04□□□□□ -1.281e-11■■■■■ 36.1
IGF2BP1Q9NZI8 NDUFB5-213ENST00000493716 476 ntTSL 26.56□□□□□ -1.361e-11■■■■■ 36.1
IGF2BP1Q9NZI8 MSL2-204ENST00000481989 576 ntTSL 44.03□□□□□ -1.761e-11■■■■■ 36.1
IGF2BP1Q9NZI8 EIF2A-213ENST00000482471 287 ntTSL 55.97□□□□□ -1.457e-10■■■■■ 35.9
IGF2BP1Q9NZI8 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.057e-7■■■■■ 35.8
IGF2BP1Q9NZI8 C22orf34-205ENST00000416411 542 ntTSL 413.82□□□□□ -0.27e-7■■■■■ 35.8
IGF2BP1Q9NZI8 SEC14L1-221ENST00000588721 647 ntTSL 216.7■□□□□ 0.261e-9■■■■■ 35.7
IGF2BP1Q9NZI8 SEC14L1-218ENST00000588488 705 ntTSL 514.2□□□□□ -0.141e-9■■■■■ 35.7
IGF2BP1Q9NZI8 SEC14L1-215ENST00000587491 2934 ntTSL 213.45□□□□□ -0.261e-9■■■■■ 35.7
IGF2BP1Q9NZI8 SEC14L1-203ENST00000431431 2504 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.351e-9■■■■■ 35.7
IGF2BP1Q9NZI8 SEC14L1-212ENST00000585618 2712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.61e-9■■■■■ 35.7
IGF2BP1Q9NZI8 SEC14L1-227ENST00000591437 2828 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.651e-9■■■■■ 35.7
IGF2BP1Q9NZI8 AL117329.1-201ENST00000423737 1815 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 35.7
IGF2BP1Q9NZI8 PCYOX1-204ENST00000433351 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.532e-8■■■■■ 35.7
IGF2BP1Q9NZI8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.922e-7■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 GTF2A1-203ENST00000553612 6306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.894e-7■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.994e-9■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 ATP5C1-210ENST00000493053 1096 ntTSL 516■□□□□ 0.154e-9■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 ATP5C1-206ENST00000465936 292 ntTSL 315.75■□□□□ 0.114e-9■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.234e-9■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 USP3-203ENST00000538686 2077 ntTSL 1 (best)13.08□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 USP3-202ENST00000380324 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 USP3-206ENST00000558157 2439 ntTSL 1 (best)11.01□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 USP3-211ENST00000559257 2217 ntTSL 59.22□□□□□ -0.931e-6■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 USP3-210ENST00000559192 5499 ntTSL 1 (best)7.1□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 MBNL2-206ENST00000469707 2574 ntTSL 1 (best)8.11□□□□□ -1.117e-7■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 RTN3-212ENST00000543123 712 ntTSL 212.95□□□□□ -0.342e-11■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 NFAT5-211ENST00000568832 850 ntTSL 27.74□□□□□ -1.172e-11■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.412e-11■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 ASNS-216ENST00000487714 689 ntTSL 25.64□□□□□ -1.514e-22■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 CD52-202ENST00000470468 381 ntTSL 34.15□□□□□ -1.752e-11■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.181e-10■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM123-204ENST00000526676 467 ntTSL 415.12■□□□□ 0.011e-20■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.382e-9■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 RNF7-203ENST00000477012 1036 ntTSL 1 (best)15.93■□□□□ 0.142e-9■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.392e-9■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 RNF7-202ENST00000393000 805 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.442e-9■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 CCNH-207ENST00000510020 582 ntTSL 34.36□□□□□ -1.714e-7■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.018e-9■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.058e-9■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 OCLN-201ENST00000355237 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.576e-7■■■■■ 35.4
IGF2BP1Q9NZI8 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.136e-7■■■■■ 35.4
IGF2BP1Q9NZI8 OCLN-204ENST00000514370 958 ntTSL 1 (best)6.54□□□□□ -1.366e-7■■■■■ 35.4
IGF2BP1Q9NZI8 EIF2A-206ENST00000465535 1273 ntTSL 57.61□□□□□ -1.193e-9■■■■■ 35.4
IGF2BP1Q9NZI8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.981e-7■■■■■ 35.4
IGF2BP1Q9NZI8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.055e-7■■■■■ 35.3
IGF2BP1Q9NZI8 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.091e-9■■■■■ 35.3
IGF2BP1Q9NZI8 CCNG1-201ENST00000340828 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.381e-9■■■■■ 35.3
IGF2BP1Q9NZI8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 35.3
IGF2BP1Q9NZI8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 35.3
IGF2BP1Q9NZI8 HSP90B1-203ENST00000548462 3032 ntTSL 211.6□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 35.3
IGF2BP1Q9NZI8 GTF2A1-204ENST00000556268 864 ntTSL 59.28□□□□□ -0.925e-7■■■■■ 35.3
IGF2BP1Q9NZI8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.592e-10■■■■■ 35.3
IGF2BP1Q9NZI8 BIRC2-202ENST00000527465 595 ntTSL 410.17□□□□□ -0.781e-7■■■■■ 35.3
IGF2BP1Q9NZI8 DCAF6-206ENST00000455334 796 ntTSL 519.07■□□□□ 0.644e-9■■■■■ 35.2
IGF2BP1Q9NZI8 DCAF6-205ENST00000450548 724 ntTSL 318.11■□□□□ 0.494e-9■■■■■ 35.2
IGF2BP1Q9NZI8 DCAF6-208ENST00000470721 2803 ntTSL 217.06■□□□□ 0.324e-9■■■■■ 35.2
IGF2BP1Q9NZI8 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.284e-9■■■■■ 35.2
IGF2BP1Q9NZI8 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.374e-9■■■■■ 35.2
IGF2BP1Q9NZI8 DCAF6-204ENST00000432587 3522 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.44e-9■■■■■ 35.2
IGF2BP1Q9NZI8 DCAF6-202ENST00000367840 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.044e-9■■■■■ 35.2
IGF2BP1Q9NZI8 DCAF6-209ENST00000470919 827 ntTSL 27.02□□□□□ -1.294e-9■■■■■ 35.2
IGF2BP1Q9NZI8 DCAF6-212ENST00000491067 536 ntTSL 34.64□□□□□ -1.674e-9■■■■■ 35.2
Retrieved 100 of 17,531 protein–RNA pairs in 445.7 ms