Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLGN3Q9NZ94 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLGN3Q9NZ94 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLGN3Q9NZ94 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLGN3Q9NZ94 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NLGN3Q9NZ94 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLGN3Q9NZ94 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLGN3Q9NZ94 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLGN3Q9NZ94 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLGN3Q9NZ94 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLGN3Q9NZ94 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLGN3Q9NZ94 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLGN3Q9NZ94 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLGN3Q9NZ94 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLGN3Q9NZ94 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLGN3Q9NZ94 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLGN3Q9NZ94 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLGN3Q9NZ94 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLGN3Q9NZ94 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLGN3Q9NZ94 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLGN3Q9NZ94 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLGN3Q9NZ94 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLGN3Q9NZ94 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLGN3Q9NZ94 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLGN3Q9NZ94 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLGN3Q9NZ94 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLGN3Q9NZ94 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLGN3Q9NZ94 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLGN3Q9NZ94 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLGN3Q9NZ94 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLGN3Q9NZ94 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLGN3Q9NZ94 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLGN3Q9NZ94 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLGN3Q9NZ94 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLGN3Q9NZ94 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLGN3Q9NZ94 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLGN3Q9NZ94 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLGN3Q9NZ94 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLGN3Q9NZ94 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLGN3Q9NZ94 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLGN3Q9NZ94 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLGN3Q9NZ94 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLGN3Q9NZ94 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLGN3Q9NZ94 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLGN3Q9NZ94 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLGN3Q9NZ94 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLGN3Q9NZ94 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLGN3Q9NZ94 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLGN3Q9NZ94 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLGN3Q9NZ94 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLGN3Q9NZ94 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLGN3Q9NZ94 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLGN3Q9NZ94 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLGN3Q9NZ94 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLGN3Q9NZ94 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NLGN3Q9NZ94 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLGN3Q9NZ94 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLGN3Q9NZ94 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLGN3Q9NZ94 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLGN3Q9NZ94 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLGN3Q9NZ94 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLGN3Q9NZ94 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLGN3Q9NZ94 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLGN3Q9NZ94 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLGN3Q9NZ94 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLGN3Q9NZ94 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLGN3Q9NZ94 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLGN3Q9NZ94 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLGN3Q9NZ94 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLGN3Q9NZ94 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLGN3Q9NZ94 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLGN3Q9NZ94 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLGN3Q9NZ94 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLGN3Q9NZ94 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLGN3Q9NZ94 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLGN3Q9NZ94 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLGN3Q9NZ94 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLGN3Q9NZ94 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms