Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PODXL2Q9NZ53 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PODXL2Q9NZ53 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PODXL2Q9NZ53 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PODXL2Q9NZ53 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PODXL2Q9NZ53 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PODXL2Q9NZ53 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PODXL2Q9NZ53 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PODXL2Q9NZ53 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PODXL2Q9NZ53 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PODXL2Q9NZ53 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PODXL2Q9NZ53 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PODXL2Q9NZ53 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PODXL2Q9NZ53 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PODXL2Q9NZ53 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PODXL2Q9NZ53 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PODXL2Q9NZ53 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PODXL2Q9NZ53 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PODXL2Q9NZ53 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PODXL2Q9NZ53 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PODXL2Q9NZ53 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PODXL2Q9NZ53 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PODXL2Q9NZ53 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PODXL2Q9NZ53 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PODXL2Q9NZ53 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PODXL2Q9NZ53 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PODXL2Q9NZ53 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PODXL2Q9NZ53 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PODXL2Q9NZ53 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PODXL2Q9NZ53 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PODXL2Q9NZ53 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PODXL2Q9NZ53 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PODXL2Q9NZ53 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PODXL2Q9NZ53 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
PODXL2Q9NZ53 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PODXL2Q9NZ53 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PODXL2Q9NZ53 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PODXL2Q9NZ53 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PODXL2Q9NZ53 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PODXL2Q9NZ53 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PODXL2Q9NZ53 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PODXL2Q9NZ53 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PODXL2Q9NZ53 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PODXL2Q9NZ53 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PODXL2Q9NZ53 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PODXL2Q9NZ53 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
PODXL2Q9NZ53 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PODXL2Q9NZ53 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PODXL2Q9NZ53 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PODXL2Q9NZ53 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
PODXL2Q9NZ53 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PODXL2Q9NZ53 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PODXL2Q9NZ53 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PODXL2Q9NZ53 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PODXL2Q9NZ53 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PODXL2Q9NZ53 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PODXL2Q9NZ53 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
PODXL2Q9NZ53 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PODXL2Q9NZ53 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PODXL2Q9NZ53 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PODXL2Q9NZ53 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
PODXL2Q9NZ53 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PODXL2Q9NZ53 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PODXL2Q9NZ53 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PODXL2Q9NZ53 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PODXL2Q9NZ53 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PODXL2Q9NZ53 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
PODXL2Q9NZ53 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
PODXL2Q9NZ53 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PODXL2Q9NZ53 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PODXL2Q9NZ53 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PODXL2Q9NZ53 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
PODXL2Q9NZ53 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PODXL2Q9NZ53 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms