Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSD3Q9NYI0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSD3Q9NYI0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSD3Q9NYI0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSD3Q9NYI0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSD3Q9NYI0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSD3Q9NYI0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSD3Q9NYI0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PSD3Q9NYI0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSD3Q9NYI0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSD3Q9NYI0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSD3Q9NYI0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSD3Q9NYI0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSD3Q9NYI0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSD3Q9NYI0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSD3Q9NYI0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSD3Q9NYI0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSD3Q9NYI0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSD3Q9NYI0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSD3Q9NYI0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSD3Q9NYI0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSD3Q9NYI0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSD3Q9NYI0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSD3Q9NYI0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSD3Q9NYI0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSD3Q9NYI0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSD3Q9NYI0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSD3Q9NYI0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSD3Q9NYI0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSD3Q9NYI0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSD3Q9NYI0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSD3Q9NYI0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSD3Q9NYI0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSD3Q9NYI0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSD3Q9NYI0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSD3Q9NYI0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSD3Q9NYI0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSD3Q9NYI0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSD3Q9NYI0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSD3Q9NYI0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSD3Q9NYI0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSD3Q9NYI0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSD3Q9NYI0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSD3Q9NYI0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSD3Q9NYI0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSD3Q9NYI0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSD3Q9NYI0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PSD3Q9NYI0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSD3Q9NYI0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PSD3Q9NYI0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSD3Q9NYI0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSD3Q9NYI0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSD3Q9NYI0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSD3Q9NYI0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSD3Q9NYI0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSD3Q9NYI0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSD3Q9NYI0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSD3Q9NYI0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSD3Q9NYI0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSD3Q9NYI0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSD3Q9NYI0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSD3Q9NYI0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PSD3Q9NYI0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSD3Q9NYI0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSD3Q9NYI0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSD3Q9NYI0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSD3Q9NYI0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSD3Q9NYI0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSD3Q9NYI0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSD3Q9NYI0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSD3Q9NYI0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSD3Q9NYI0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSD3Q9NYI0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSD3Q9NYI0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSD3Q9NYI0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSD3Q9NYI0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSD3Q9NYI0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSD3Q9NYI0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSD3Q9NYI0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSD3Q9NYI0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSD3Q9NYI0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSD3Q9NYI0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSD3Q9NYI0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSD3Q9NYI0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSD3Q9NYI0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSD3Q9NYI0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSD3Q9NYI0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSD3Q9NYI0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSD3Q9NYI0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSD3Q9NYI0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSD3Q9NYI0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSD3Q9NYI0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSD3Q9NYI0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSD3Q9NYI0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSD3Q9NYI0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PSD3Q9NYI0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSD3Q9NYI0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSD3Q9NYI0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSD3Q9NYI0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSD3Q9NYI0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms