Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

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Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPHK1Q9NYA1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPHK1Q9NYA1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPHK1Q9NYA1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPHK1Q9NYA1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPHK1Q9NYA1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPHK1Q9NYA1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHK1Q9NYA1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHK1Q9NYA1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHK1Q9NYA1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHK1Q9NYA1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHK1Q9NYA1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHK1Q9NYA1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHK1Q9NYA1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHK1Q9NYA1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPHK1Q9NYA1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPHK1Q9NYA1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPHK1Q9NYA1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPHK1Q9NYA1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPHK1Q9NYA1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPHK1Q9NYA1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPHK1Q9NYA1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPHK1Q9NYA1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPHK1Q9NYA1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPHK1Q9NYA1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPHK1Q9NYA1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPHK1Q9NYA1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPHK1Q9NYA1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPHK1Q9NYA1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHK1Q9NYA1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHK1Q9NYA1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPHK1Q9NYA1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPHK1Q9NYA1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHK1Q9NYA1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHK1Q9NYA1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHK1Q9NYA1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHK1Q9NYA1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHK1Q9NYA1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHK1Q9NYA1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPHK1Q9NYA1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPHK1Q9NYA1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPHK1Q9NYA1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPHK1Q9NYA1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPHK1Q9NYA1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPHK1Q9NYA1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPHK1Q9NYA1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPHK1Q9NYA1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPHK1Q9NYA1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPHK1Q9NYA1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPHK1Q9NYA1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SPHK1Q9NYA1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPHK1Q9NYA1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPHK1Q9NYA1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPHK1Q9NYA1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPHK1Q9NYA1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPHK1Q9NYA1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SPHK1Q9NYA1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHK1Q9NYA1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHK1Q9NYA1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHK1Q9NYA1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHK1Q9NYA1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHK1Q9NYA1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHK1Q9NYA1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHK1Q9NYA1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHK1Q9NYA1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHK1Q9NYA1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHK1Q9NYA1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHK1Q9NYA1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHK1Q9NYA1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHK1Q9NYA1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHK1Q9NYA1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHK1Q9NYA1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHK1Q9NYA1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHK1Q9NYA1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHK1Q9NYA1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHK1Q9NYA1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHK1Q9NYA1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPHK1Q9NYA1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPHK1Q9NYA1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPHK1Q9NYA1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SPHK1Q9NYA1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPHK1Q9NYA1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPHK1Q9NYA1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHK1Q9NYA1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHK1Q9NYA1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHK1Q9NYA1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHK1Q9NYA1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPHK1Q9NYA1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPHK1Q9NYA1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPHK1Q9NYA1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHK1Q9NYA1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHK1Q9NYA1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHK1Q9NYA1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPHK1Q9NYA1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHK1Q9NYA1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHK1Q9NYA1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHK1Q9NYA1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHK1Q9NYA1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHK1Q9NYA1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHK1Q9NYA1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
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