Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY87

SPANXC, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXCQ9NY87 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPANXCQ9NY87 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPANXCQ9NY87 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPANXCQ9NY87 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPANXCQ9NY87 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPANXCQ9NY87 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPANXCQ9NY87 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPANXCQ9NY87 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPANXCQ9NY87 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPANXCQ9NY87 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPANXCQ9NY87 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPANXCQ9NY87 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPANXCQ9NY87 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPANXCQ9NY87 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPANXCQ9NY87 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPANXCQ9NY87 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPANXCQ9NY87 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPANXCQ9NY87 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPANXCQ9NY87 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPANXCQ9NY87 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPANXCQ9NY87 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPANXCQ9NY87 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPANXCQ9NY87 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPANXCQ9NY87 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SPANXCQ9NY87 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPANXCQ9NY87 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPANXCQ9NY87 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPANXCQ9NY87 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPANXCQ9NY87 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPANXCQ9NY87 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPANXCQ9NY87 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXCQ9NY87 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXCQ9NY87 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXCQ9NY87 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXCQ9NY87 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPANXCQ9NY87 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPANXCQ9NY87 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPANXCQ9NY87 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPANXCQ9NY87 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms