Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 JADE1-201ENST00000226319 5772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 58
AATFQ9NY61 JADE1-213ENST00000610919 5644 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.354e-7■■■■■ 58
AATFQ9NY61 JADE1-211ENST00000512960 3000 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.414e-7■■■■■ 58
AATFQ9NY61 JADE1-214ENST00000611140 5648 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.554e-7■■■■■ 58
AATFQ9NY61 JADE1-202ENST00000413543 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.84e-7■■■■■ 58
AATFQ9NY61 JADE1-203ENST00000452328 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.84e-7■■■■■ 58
AATFQ9NY61 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC8.54□□□□□ -1.042e-10■■■■■ 57.8
AATFQ9NY61 SNORD91A-201ENST00000390861 95 nt-0.26□□□□□ -2.452e-10■■■■■ 57.8
AATFQ9NY61 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.055e-7■■■■■ 57.7
AATFQ9NY61 MFGE8-214ENST00000560937 801 ntTSL 221.87■■□□□ 1.099e-7■■■■■ 57.4
AATFQ9NY61 TRAF7-206ENST00000569686 586 ntTSL 231.36■■■□□ 2.612e-6■■■■■ 57.4
AATFQ9NY61 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.12e-6■■■■■ 57.4
AATFQ9NY61 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.072e-6■■■■■ 57.4
AATFQ9NY61 TRAF7-202ENST00000564067 874 ntTSL 321.76■■□□□ 1.072e-6■■■■■ 57.4
AATFQ9NY61 TRAF7-204ENST00000567645 737 ntTSL 517.78■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 57.4
AATFQ9NY61 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 57.4
AATFQ9NY61 PIGH-206ENST00000559097 962 ntTSL 224.73■■□□□ 1.552e-8■■■■■ 57.4
AATFQ9NY61 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.432e-8■■■■■ 57.4
AATFQ9NY61 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.452e-8■■■■■ 57.4
AATFQ9NY61 PIGH-208ENST00000559415 476 ntTSL 316.02■□□□□ 0.162e-8■■■■■ 57.4
AATFQ9NY61 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.162e-8■■■■■ 57.4
AATFQ9NY61 PIGH-202ENST00000558001 594 ntTSL 215.39■□□□□ 0.052e-8■■■■■ 57.4
AATFQ9NY61 PIGH-212ENST00000561303 593 ntTSL 314.07□□□□□ -0.162e-8■■■■■ 57.4
AATFQ9NY61 PIGH-211ENST00000561272 760 ntTSL 211.59□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 57.4
AATFQ9NY61 PIGH-203ENST00000558198 583 ntTSL 310.62□□□□□ -0.712e-8■■■■■ 57.4
AATFQ9NY61 PIGH-205ENST00000558987 841 ntTSL 28.44□□□□□ -1.062e-8■■■■■ 57.4
AATFQ9NY61 PIGH-204ENST00000558493 499 ntTSL 38.36□□□□□ -1.072e-8■■■■■ 57.4
AATFQ9NY61 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.881e-11■■■■■ 57.3
AATFQ9NY61 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 57.3
AATFQ9NY61 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 57.3
AATFQ9NY61 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 57.3
AATFQ9NY61 PPFIA4-211ENST00000600426 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.55□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 57.3
AATFQ9NY61 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 57.3
AATFQ9NY61 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 57.3
AATFQ9NY61 AL390334.1-204ENST00000556890 578 ntTSL 1 (best)8.11□□□□□ -1.111e-11■■■■■ 57.3
AATFQ9NY61 AL390334.1-202ENST00000553392 674 ntTSL 37.55□□□□□ -1.21e-11■■■■■ 57.3
AATFQ9NY61 AL390334.1-203ENST00000554904 569 ntTSL 44.47□□□□□ -1.691e-11■■■■■ 57.3
AATFQ9NY61 GAS5-228ENST00000456812 723 ntTSL 38.41□□□□□ -1.063e-49■■■■■ 56.8
AATFQ9NY61 GAS5-206ENST00000422183 745 ntTSL 27.28□□□□□ -1.243e-49■■■■■ 56.8
AATFQ9NY61 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.263e-49■■■■■ 56.8
AATFQ9NY61 GAS5-213ENST00000436285 772 ntTSL 24.19□□□□□ -1.743e-49■■■■■ 56.8
AATFQ9NY61 C6orf48-201ENST00000375633 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.891e-323■■■■■ 56.7
AATFQ9NY61 IQCE-205ENST00000415271 899 ntTSL 525.76■■□□□ 1.717e-7■■■■■ 56.5
AATFQ9NY61 IQCE-202ENST00000325997 2235 ntTSL 1 (best)24.93■■□□□ 1.587e-7■■■■■ 56.5
AATFQ9NY61 IQCE-211ENST00000470731 2251 ntTSL 1 (best)23.44■■□□□ 1.347e-7■■■■■ 56.5
AATFQ9NY61 IQCE-208ENST00000423395 543 ntTSL 520.39■□□□□ 0.857e-7■■■■■ 56.5
AATFQ9NY61 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.827e-7■■■■■ 56.5
AATFQ9NY61 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.797e-7■■■■■ 56.5
AATFQ9NY61 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.657e-7■■■■■ 56.5
AATFQ9NY61 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.627e-7■■■■■ 56.5
AATFQ9NY61 IQCE-206ENST00000422276 541 ntTSL 518.26■□□□□ 0.517e-7■■■■■ 56.5
AATFQ9NY61 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.337e-7■■■■■ 56.5
AATFQ9NY61 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.297e-7■■■■■ 56.5
AATFQ9NY61 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.297e-7■■■■■ 56.5
AATFQ9NY61 CEP72-203ENST00000512038 656 ntTSL 220.6■□□□□ 0.891e-8■■■■■ 56.3
AATFQ9NY61 NTM-222ENST00000550167 644 ntTSL 514.9□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 56
AATFQ9NY61 NTM-207ENST00000436745 436 ntTSL 314.08□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 56
AATFQ9NY61 NTM-203ENST00000374791 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 56
AATFQ9NY61 NTM-213ENST00000477098 563 ntTSL 38.73□□□□□ -1.013e-6■■■■■ 56
AATFQ9NY61 ANKRD11-210ENST00000566858 580 ntTSL 419.59■□□□□ 0.735e-7■■■■■ 56
AATFQ9NY61 ANKRD11-212ENST00000567699 412 ntTSL 518.25■□□□□ 0.515e-7■■■■■ 56
AATFQ9NY61 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.395e-7■■■■■ 56
AATFQ9NY61 ANKRD11-213ENST00000567736 2750 ntTSL 217.25■□□□□ 0.355e-7■■■■■ 56
AATFQ9NY61 ANKRD11-216ENST00000568924 587 ntTSL 416.75■□□□□ 0.275e-7■■■■■ 56
AATFQ9NY61 ULK1-205ENST00000541761 1262 ntTSL 218.82■□□□□ 0.62e-7■■■■■ 55.9
AATFQ9NY61 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.48e-7■■■■■ 55.8
AATFQ9NY61 SPPL2B-213ENST00000621568 1017 ntTSL 521.7■■□□□ 1.068e-7■■■■■ 55.8
AATFQ9NY61 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.458e-7■■■■■ 55.8
AATFQ9NY61 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.078e-7■■■■■ 55.8
AATFQ9NY61 C7orf50-204ENST00000412051 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 226.28■■□□□ 1.86e-7■■■■■ 55.4
AATFQ9NY61 C7orf50-205ENST00000444428 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.81■□□□□ 0.66e-7■■■■■ 55.4
AATFQ9NY61 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.565e-7■■■■■ 55.4
AATFQ9NY61 UBAC1-202ENST00000465873 882 ntTSL 219.87■□□□□ 0.775e-7■■■■■ 55.4
AATFQ9NY61 UBAC1-206ENST00000489050 864 ntTSL 311.66□□□□□ -0.545e-7■■■■■ 55.4
AATFQ9NY61 ANKRD11-209ENST00000564553 471 ntTSL 316.69■□□□□ 0.265e-7■■■■■ 55
AATFQ9NY61 ANKRD11-206ENST00000562275 2762 ntTSL 515.88■□□□□ 0.135e-7■■■■■ 55
AATFQ9NY61 ANKRD11-202ENST00000330736 8342 ntTSL 514.96□□□□□ -0.015e-7■■■■■ 55
AATFQ9NY61 ASPSCR1-213ENST00000582355 1246 ntTSL 528.82■■■□□ 2.23e-7■■■■■ 54.8
AATFQ9NY61 ASPSCR1-219ENST00000584454 1919 ntTSL 1 (best)26.75■■□□□ 1.873e-7■■■■■ 54.8
AATFQ9NY61 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.823e-7■■■■■ 54.8
AATFQ9NY61 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.733e-7■■■■■ 54.8
AATFQ9NY61 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.733e-7■■■■■ 54.8
AATFQ9NY61 ASPSCR1-216ENST00000583503 641 ntTSL 321.91■■□□□ 1.13e-7■■■■■ 54.8
AATFQ9NY61 ASPSCR1-204ENST00000577733 5503 ntTSL 218.96■□□□□ 0.633e-7■■■■■ 54.8
AATFQ9NY61 AXIN1-205ENST00000481769 1089 ntTSL 332.68■■■□□ 2.826e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 MFSD12-208ENST00000588918 2040 ntTSL 530.52■■■□□ 2.486e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.436e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.326e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.196e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.186e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.186e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 CAPN1-222ENST00000532285 568 ntTSL 427.98■■■□□ 2.076e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.056e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 NUBP2-205ENST00000564227 903 ntTSL 327.11■■□□□ 1.936e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.896e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.876e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.866e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.786e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.736e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.716e-6■■■■■ 54.7
Retrieved 100 of 5,565 protein–RNA pairs in 379.7 ms