Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPTLC3Q9NUV7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPTLC3Q9NUV7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPTLC3Q9NUV7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPTLC3Q9NUV7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPTLC3Q9NUV7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPTLC3Q9NUV7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPTLC3Q9NUV7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPTLC3Q9NUV7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPTLC3Q9NUV7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPTLC3Q9NUV7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPTLC3Q9NUV7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPTLC3Q9NUV7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPTLC3Q9NUV7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPTLC3Q9NUV7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPTLC3Q9NUV7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPTLC3Q9NUV7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPTLC3Q9NUV7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPTLC3Q9NUV7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPTLC3Q9NUV7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPTLC3Q9NUV7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPTLC3Q9NUV7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPTLC3Q9NUV7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPTLC3Q9NUV7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPTLC3Q9NUV7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPTLC3Q9NUV7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPTLC3Q9NUV7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPTLC3Q9NUV7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPTLC3Q9NUV7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
SPTLC3Q9NUV7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPTLC3Q9NUV7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPTLC3Q9NUV7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPTLC3Q9NUV7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPTLC3Q9NUV7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPTLC3Q9NUV7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPTLC3Q9NUV7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPTLC3Q9NUV7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPTLC3Q9NUV7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPTLC3Q9NUV7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPTLC3Q9NUV7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPTLC3Q9NUV7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPTLC3Q9NUV7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPTLC3Q9NUV7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPTLC3Q9NUV7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPTLC3Q9NUV7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPTLC3Q9NUV7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPTLC3Q9NUV7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
SPTLC3Q9NUV7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPTLC3Q9NUV7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPTLC3Q9NUV7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPTLC3Q9NUV7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPTLC3Q9NUV7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPTLC3Q9NUV7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPTLC3Q9NUV7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPTLC3Q9NUV7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPTLC3Q9NUV7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPTLC3Q9NUV7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPTLC3Q9NUV7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPTLC3Q9NUV7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPTLC3Q9NUV7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPTLC3Q9NUV7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SPTLC3Q9NUV7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPTLC3Q9NUV7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPTLC3Q9NUV7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPTLC3Q9NUV7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPTLC3Q9NUV7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPTLC3Q9NUV7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPTLC3Q9NUV7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPTLC3Q9NUV7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPTLC3Q9NUV7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPTLC3Q9NUV7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPTLC3Q9NUV7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPTLC3Q9NUV7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPTLC3Q9NUV7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPTLC3Q9NUV7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPTLC3Q9NUV7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPTLC3Q9NUV7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPTLC3Q9NUV7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPTLC3Q9NUV7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPTLC3Q9NUV7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPTLC3Q9NUV7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPTLC3Q9NUV7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPTLC3Q9NUV7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPTLC3Q9NUV7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPTLC3Q9NUV7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPTLC3Q9NUV7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPTLC3Q9NUV7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPTLC3Q9NUV7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SPTLC3Q9NUV7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPTLC3Q9NUV7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPTLC3Q9NUV7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPTLC3Q9NUV7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPTLC3Q9NUV7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPTLC3Q9NUV7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPTLC3Q9NUV7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPTLC3Q9NUV7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPTLC3Q9NUV7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPTLC3Q9NUV7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPTLC3Q9NUV7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPTLC3Q9NUV7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms