Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A9Q9NUM3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A9Q9NUM3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A9Q9NUM3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A9Q9NUM3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A9Q9NUM3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A9Q9NUM3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A9Q9NUM3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A9Q9NUM3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A9Q9NUM3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A9Q9NUM3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A9Q9NUM3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A9Q9NUM3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A9Q9NUM3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A9Q9NUM3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A9Q9NUM3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A9Q9NUM3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A9Q9NUM3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A9Q9NUM3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A9Q9NUM3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A9Q9NUM3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A9Q9NUM3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC39A9Q9NUM3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC39A9Q9NUM3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC39A9Q9NUM3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC39A9Q9NUM3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC39A9Q9NUM3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC39A9Q9NUM3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC39A9Q9NUM3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC39A9Q9NUM3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC39A9Q9NUM3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC39A9Q9NUM3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC39A9Q9NUM3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC39A9Q9NUM3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC39A9Q9NUM3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC39A9Q9NUM3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC39A9Q9NUM3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC39A9Q9NUM3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC39A9Q9NUM3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC39A9Q9NUM3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC39A9Q9NUM3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC39A9Q9NUM3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC39A9Q9NUM3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC39A9Q9NUM3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC39A9Q9NUM3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC39A9Q9NUM3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC39A9Q9NUM3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC39A9Q9NUM3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC39A9Q9NUM3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC39A9Q9NUM3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC39A9Q9NUM3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC39A9Q9NUM3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC39A9Q9NUM3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC39A9Q9NUM3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC39A9Q9NUM3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC39A9Q9NUM3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC39A9Q9NUM3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A9Q9NUM3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A9Q9NUM3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A9Q9NUM3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A9Q9NUM3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC39A9Q9NUM3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms