Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO6Q9NRD1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO6Q9NRD1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO6Q9NRD1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO6Q9NRD1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO6Q9NRD1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO6Q9NRD1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO6Q9NRD1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO6Q9NRD1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO6Q9NRD1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO6Q9NRD1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO6Q9NRD1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO6Q9NRD1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO6Q9NRD1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO6Q9NRD1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO6Q9NRD1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO6Q9NRD1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO6Q9NRD1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO6Q9NRD1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO6Q9NRD1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXO6Q9NRD1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXO6Q9NRD1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO6Q9NRD1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO6Q9NRD1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO6Q9NRD1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO6Q9NRD1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO6Q9NRD1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO6Q9NRD1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO6Q9NRD1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO6Q9NRD1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO6Q9NRD1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO6Q9NRD1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FBXO6Q9NRD1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO6Q9NRD1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO6Q9NRD1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO6Q9NRD1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO6Q9NRD1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO6Q9NRD1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO6Q9NRD1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO6Q9NRD1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO6Q9NRD1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO6Q9NRD1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO6Q9NRD1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO6Q9NRD1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO6Q9NRD1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO6Q9NRD1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXO6Q9NRD1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXO6Q9NRD1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXO6Q9NRD1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
FBXO6Q9NRD1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FBXO6Q9NRD1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO6Q9NRD1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO6Q9NRD1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO6Q9NRD1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO6Q9NRD1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO6Q9NRD1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO6Q9NRD1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO6Q9NRD1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO6Q9NRD1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO6Q9NRD1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO6Q9NRD1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO6Q9NRD1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO6Q9NRD1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO6Q9NRD1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO6Q9NRD1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO6Q9NRD1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO6Q9NRD1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO6Q9NRD1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO6Q9NRD1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO6Q9NRD1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO6Q9NRD1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO6Q9NRD1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO6Q9NRD1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO6Q9NRD1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO6Q9NRD1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO6Q9NRD1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FBXO6Q9NRD1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO6Q9NRD1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO6Q9NRD1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO6Q9NRD1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO6Q9NRD1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO6Q9NRD1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO6Q9NRD1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO6Q9NRD1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO6Q9NRD1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO6Q9NRD1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO6Q9NRD1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO6Q9NRD1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO6Q9NRD1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO6Q9NRD1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO6Q9NRD1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO6Q9NRD1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO6Q9NRD1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO6Q9NRD1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO6Q9NRD1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO6Q9NRD1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO6Q9NRD1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO6Q9NRD1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO6Q9NRD1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO6Q9NRD1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.5 ms