Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GDF3Q9NR23 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GDF3Q9NR23 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GDF3Q9NR23 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GDF3Q9NR23 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GDF3Q9NR23 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GDF3Q9NR23 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GDF3Q9NR23 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GDF3Q9NR23 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GDF3Q9NR23 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GDF3Q9NR23 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GDF3Q9NR23 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GDF3Q9NR23 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GDF3Q9NR23 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GDF3Q9NR23 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GDF3Q9NR23 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GDF3Q9NR23 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GDF3Q9NR23 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GDF3Q9NR23 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GDF3Q9NR23 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GDF3Q9NR23 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GDF3Q9NR23 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GDF3Q9NR23 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GDF3Q9NR23 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GDF3Q9NR23 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GDF3Q9NR23 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GDF3Q9NR23 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GDF3Q9NR23 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GDF3Q9NR23 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GDF3Q9NR23 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GDF3Q9NR23 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GDF3Q9NR23 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GDF3Q9NR23 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GDF3Q9NR23 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GDF3Q9NR23 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GDF3Q9NR23 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GDF3Q9NR23 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GDF3Q9NR23 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GDF3Q9NR23 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GDF3Q9NR23 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GDF3Q9NR23 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GDF3Q9NR23 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GDF3Q9NR23 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GDF3Q9NR23 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GDF3Q9NR23 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GDF3Q9NR23 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GDF3Q9NR23 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GDF3Q9NR23 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GDF3Q9NR23 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GDF3Q9NR23 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GDF3Q9NR23 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GDF3Q9NR23 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GDF3Q9NR23 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GDF3Q9NR23 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GDF3Q9NR23 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GDF3Q9NR23 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GDF3Q9NR23 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GDF3Q9NR23 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GDF3Q9NR23 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GDF3Q9NR23 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GDF3Q9NR23 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GDF3Q9NR23 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GDF3Q9NR23 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GDF3Q9NR23 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GDF3Q9NR23 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GDF3Q9NR23 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GDF3Q9NR23 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GDF3Q9NR23 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GDF3Q9NR23 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GDF3Q9NR23 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GDF3Q9NR23 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GDF3Q9NR23 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GDF3Q9NR23 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GDF3Q9NR23 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GDF3Q9NR23 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GDF3Q9NR23 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GDF3Q9NR23 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GDF3Q9NR23 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GDF3Q9NR23 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GDF3Q9NR23 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GDF3Q9NR23 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GDF3Q9NR23 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GDF3Q9NR23 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GDF3Q9NR23 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GDF3Q9NR23 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GDF3Q9NR23 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GDF3Q9NR23 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GDF3Q9NR23 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GDF3Q9NR23 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GDF3Q9NR23 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GDF3Q9NR23 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GDF3Q9NR23 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GDF3Q9NR23 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GDF3Q9NR23 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GDF3Q9NR23 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GDF3Q9NR23 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GDF3Q9NR23 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GDF3Q9NR23 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GDF3Q9NR23 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GDF3Q9NR23 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms