Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDLIM7Q9NR12 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDLIM7Q9NR12 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDLIM7Q9NR12 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDLIM7Q9NR12 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDLIM7Q9NR12 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDLIM7Q9NR12 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDLIM7Q9NR12 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDLIM7Q9NR12 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDLIM7Q9NR12 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDLIM7Q9NR12 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDLIM7Q9NR12 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PDLIM7Q9NR12 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDLIM7Q9NR12 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDLIM7Q9NR12 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDLIM7Q9NR12 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDLIM7Q9NR12 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDLIM7Q9NR12 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PDLIM7Q9NR12 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDLIM7Q9NR12 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDLIM7Q9NR12 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDLIM7Q9NR12 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDLIM7Q9NR12 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDLIM7Q9NR12 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDLIM7Q9NR12 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDLIM7Q9NR12 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDLIM7Q9NR12 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDLIM7Q9NR12 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDLIM7Q9NR12 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDLIM7Q9NR12 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDLIM7Q9NR12 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDLIM7Q9NR12 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDLIM7Q9NR12 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDLIM7Q9NR12 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDLIM7Q9NR12 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDLIM7Q9NR12 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PDLIM7Q9NR12 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDLIM7Q9NR12 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDLIM7Q9NR12 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDLIM7Q9NR12 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDLIM7Q9NR12 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDLIM7Q9NR12 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDLIM7Q9NR12 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDLIM7Q9NR12 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDLIM7Q9NR12 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDLIM7Q9NR12 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDLIM7Q9NR12 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDLIM7Q9NR12 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDLIM7Q9NR12 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDLIM7Q9NR12 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDLIM7Q9NR12 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PDLIM7Q9NR12 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDLIM7Q9NR12 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDLIM7Q9NR12 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDLIM7Q9NR12 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDLIM7Q9NR12 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDLIM7Q9NR12 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDLIM7Q9NR12 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDLIM7Q9NR12 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDLIM7Q9NR12 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDLIM7Q9NR12 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDLIM7Q9NR12 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDLIM7Q9NR12 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDLIM7Q9NR12 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDLIM7Q9NR12 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDLIM7Q9NR12 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDLIM7Q9NR12 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDLIM7Q9NR12 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDLIM7Q9NR12 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PDLIM7Q9NR12 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDLIM7Q9NR12 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDLIM7Q9NR12 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDLIM7Q9NR12 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDLIM7Q9NR12 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDLIM7Q9NR12 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDLIM7Q9NR12 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDLIM7Q9NR12 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDLIM7Q9NR12 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDLIM7Q9NR12 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PDLIM7Q9NR12 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDLIM7Q9NR12 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PDLIM7Q9NR12 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDLIM7Q9NR12 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDLIM7Q9NR12 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDLIM7Q9NR12 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDLIM7Q9NR12 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDLIM7Q9NR12 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDLIM7Q9NR12 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDLIM7Q9NR12 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDLIM7Q9NR12 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDLIM7Q9NR12 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDLIM7Q9NR12 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PDLIM7Q9NR12 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PDLIM7Q9NR12 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDLIM7Q9NR12 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDLIM7Q9NR12 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDLIM7Q9NR12 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDLIM7Q9NR12 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDLIM7Q9NR12 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDLIM7Q9NR12 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 547.5 ms