Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPRD1BQ9NQG5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPRD1BQ9NQG5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPRD1BQ9NQG5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPRD1BQ9NQG5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPRD1BQ9NQG5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPRD1BQ9NQG5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPRD1BQ9NQG5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPRD1BQ9NQG5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPRD1BQ9NQG5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPRD1BQ9NQG5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPRD1BQ9NQG5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPRD1BQ9NQG5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPRD1BQ9NQG5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPRD1BQ9NQG5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPRD1BQ9NQG5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPRD1BQ9NQG5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPRD1BQ9NQG5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPRD1BQ9NQG5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPRD1BQ9NQG5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPRD1BQ9NQG5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPRD1BQ9NQG5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPRD1BQ9NQG5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPRD1BQ9NQG5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPRD1BQ9NQG5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPRD1BQ9NQG5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPRD1BQ9NQG5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPRD1BQ9NQG5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPRD1BQ9NQG5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPRD1BQ9NQG5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPRD1BQ9NQG5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPRD1BQ9NQG5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPRD1BQ9NQG5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPRD1BQ9NQG5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPRD1BQ9NQG5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPRD1BQ9NQG5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPRD1BQ9NQG5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPRD1BQ9NQG5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPRD1BQ9NQG5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPRD1BQ9NQG5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPRD1BQ9NQG5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPRD1BQ9NQG5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPRD1BQ9NQG5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPRD1BQ9NQG5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPRD1BQ9NQG5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPRD1BQ9NQG5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPRD1BQ9NQG5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPRD1BQ9NQG5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPRD1BQ9NQG5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPRD1BQ9NQG5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPRD1BQ9NQG5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPRD1BQ9NQG5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPRD1BQ9NQG5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPRD1BQ9NQG5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPRD1BQ9NQG5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPRD1BQ9NQG5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPRD1BQ9NQG5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPRD1BQ9NQG5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms