Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG3

UBN1, Ubinuclein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBN1Q9NPG3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
UBN1Q9NPG3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
UBN1Q9NPG3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
UBN1Q9NPG3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
UBN1Q9NPG3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
UBN1Q9NPG3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
UBN1Q9NPG3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
UBN1Q9NPG3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
UBN1Q9NPG3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
UBN1Q9NPG3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBN1Q9NPG3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBN1Q9NPG3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBN1Q9NPG3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBN1Q9NPG3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBN1Q9NPG3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBN1Q9NPG3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBN1Q9NPG3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBN1Q9NPG3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBN1Q9NPG3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBN1Q9NPG3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBN1Q9NPG3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBN1Q9NPG3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBN1Q9NPG3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBN1Q9NPG3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBN1Q9NPG3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBN1Q9NPG3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBN1Q9NPG3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBN1Q9NPG3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBN1Q9NPG3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
UBN1Q9NPG3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBN1Q9NPG3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBN1Q9NPG3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBN1Q9NPG3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBN1Q9NPG3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBN1Q9NPG3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBN1Q9NPG3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBN1Q9NPG3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBN1Q9NPG3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBN1Q9NPG3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBN1Q9NPG3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBN1Q9NPG3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBN1Q9NPG3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
UBN1Q9NPG3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBN1Q9NPG3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBN1Q9NPG3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBN1Q9NPG3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBN1Q9NPG3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBN1Q9NPG3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBN1Q9NPG3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBN1Q9NPG3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBN1Q9NPG3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBN1Q9NPG3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBN1Q9NPG3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBN1Q9NPG3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBN1Q9NPG3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
UBN1Q9NPG3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UBN1Q9NPG3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBN1Q9NPG3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBN1Q9NPG3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBN1Q9NPG3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBN1Q9NPG3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBN1Q9NPG3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBN1Q9NPG3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBN1Q9NPG3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBN1Q9NPG3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBN1Q9NPG3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBN1Q9NPG3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBN1Q9NPG3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBN1Q9NPG3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBN1Q9NPG3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBN1Q9NPG3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
UBN1Q9NPG3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBN1Q9NPG3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
UBN1Q9NPG3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBN1Q9NPG3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBN1Q9NPG3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBN1Q9NPG3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBN1Q9NPG3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBN1Q9NPG3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBN1Q9NPG3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBN1Q9NPG3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBN1Q9NPG3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBN1Q9NPG3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBN1Q9NPG3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBN1Q9NPG3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBN1Q9NPG3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBN1Q9NPG3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBN1Q9NPG3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBN1Q9NPG3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBN1Q9NPG3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBN1Q9NPG3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBN1Q9NPG3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBN1Q9NPG3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBN1Q9NPG3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
UBN1Q9NPG3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBN1Q9NPG3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBN1Q9NPG3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UBN1Q9NPG3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBN1Q9NPG3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBN1Q9NPG3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms