Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE3

NOP10, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP10Q9NPE3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NOP10Q9NPE3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NOP10Q9NPE3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NOP10Q9NPE3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NOP10Q9NPE3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NOP10Q9NPE3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NOP10Q9NPE3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NOP10Q9NPE3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NOP10Q9NPE3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NOP10Q9NPE3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NOP10Q9NPE3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOP10Q9NPE3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOP10Q9NPE3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOP10Q9NPE3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NOP10Q9NPE3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NOP10Q9NPE3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NOP10Q9NPE3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NOP10Q9NPE3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NOP10Q9NPE3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NOP10Q9NPE3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NOP10Q9NPE3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NOP10Q9NPE3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
NOP10Q9NPE3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOP10Q9NPE3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOP10Q9NPE3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOP10Q9NPE3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NOP10Q9NPE3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NOP10Q9NPE3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NOP10Q9NPE3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOP10Q9NPE3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOP10Q9NPE3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOP10Q9NPE3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOP10Q9NPE3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOP10Q9NPE3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOP10Q9NPE3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOP10Q9NPE3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOP10Q9NPE3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOP10Q9NPE3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms