Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC4Q9NNZ3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms