Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC4Q9NNZ3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC4Q9NNZ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC4Q9NNZ3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAJC4Q9NNZ3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms