Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBT6

CDH20, Cadherin-20, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH20Q9HBT6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH20Q9HBT6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH20Q9HBT6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH20Q9HBT6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH20Q9HBT6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH20Q9HBT6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH20Q9HBT6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH20Q9HBT6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH20Q9HBT6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH20Q9HBT6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH20Q9HBT6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH20Q9HBT6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH20Q9HBT6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH20Q9HBT6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH20Q9HBT6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH20Q9HBT6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH20Q9HBT6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH20Q9HBT6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH20Q9HBT6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms