Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ1

CLK4, Dual specificity protein kinase CLK4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4Q9HAZ1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLK4Q9HAZ1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLK4Q9HAZ1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLK4Q9HAZ1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLK4Q9HAZ1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLK4Q9HAZ1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLK4Q9HAZ1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLK4Q9HAZ1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLK4Q9HAZ1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLK4Q9HAZ1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLK4Q9HAZ1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLK4Q9HAZ1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLK4Q9HAZ1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLK4Q9HAZ1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLK4Q9HAZ1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLK4Q9HAZ1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLK4Q9HAZ1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLK4Q9HAZ1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLK4Q9HAZ1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLK4Q9HAZ1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLK4Q9HAZ1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLK4Q9HAZ1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLK4Q9HAZ1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLK4Q9HAZ1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLK4Q9HAZ1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLK4Q9HAZ1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CLK4Q9HAZ1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLK4Q9HAZ1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLK4Q9HAZ1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLK4Q9HAZ1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLK4Q9HAZ1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLK4Q9HAZ1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLK4Q9HAZ1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLK4Q9HAZ1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLK4Q9HAZ1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLK4Q9HAZ1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLK4Q9HAZ1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLK4Q9HAZ1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLK4Q9HAZ1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLK4Q9HAZ1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLK4Q9HAZ1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CLK4Q9HAZ1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK4Q9HAZ1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK4Q9HAZ1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK4Q9HAZ1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK4Q9HAZ1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK4Q9HAZ1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK4Q9HAZ1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLK4Q9HAZ1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLK4Q9HAZ1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLK4Q9HAZ1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLK4Q9HAZ1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLK4Q9HAZ1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLK4Q9HAZ1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLK4Q9HAZ1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLK4Q9HAZ1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLK4Q9HAZ1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLK4Q9HAZ1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLK4Q9HAZ1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLK4Q9HAZ1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLK4Q9HAZ1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLK4Q9HAZ1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLK4Q9HAZ1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLK4Q9HAZ1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLK4Q9HAZ1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CLK4Q9HAZ1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLK4Q9HAZ1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLK4Q9HAZ1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLK4Q9HAZ1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLK4Q9HAZ1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLK4Q9HAZ1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CLK4Q9HAZ1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLK4Q9HAZ1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLK4Q9HAZ1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLK4Q9HAZ1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLK4Q9HAZ1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLK4Q9HAZ1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLK4Q9HAZ1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLK4Q9HAZ1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLK4Q9HAZ1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK4Q9HAZ1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK4Q9HAZ1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK4Q9HAZ1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK4Q9HAZ1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK4Q9HAZ1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLK4Q9HAZ1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLK4Q9HAZ1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLK4Q9HAZ1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLK4Q9HAZ1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLK4Q9HAZ1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLK4Q9HAZ1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLK4Q9HAZ1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLK4Q9HAZ1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLK4Q9HAZ1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLK4Q9HAZ1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLK4Q9HAZ1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLK4Q9HAZ1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLK4Q9HAZ1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLK4Q9HAZ1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLK4Q9HAZ1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms