Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RETREG1Q9H6L5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RETREG1Q9H6L5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RETREG1Q9H6L5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RETREG1Q9H6L5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RETREG1Q9H6L5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RETREG1Q9H6L5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RETREG1Q9H6L5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RETREG1Q9H6L5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RETREG1Q9H6L5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RETREG1Q9H6L5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RETREG1Q9H6L5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RETREG1Q9H6L5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RETREG1Q9H6L5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RETREG1Q9H6L5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RETREG1Q9H6L5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RETREG1Q9H6L5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RETREG1Q9H6L5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RETREG1Q9H6L5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RETREG1Q9H6L5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RETREG1Q9H6L5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RETREG1Q9H6L5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RETREG1Q9H6L5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RETREG1Q9H6L5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RETREG1Q9H6L5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RETREG1Q9H6L5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RETREG1Q9H6L5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RETREG1Q9H6L5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RETREG1Q9H6L5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RETREG1Q9H6L5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RETREG1Q9H6L5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RETREG1Q9H6L5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RETREG1Q9H6L5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RETREG1Q9H6L5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RETREG1Q9H6L5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RETREG1Q9H6L5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RETREG1Q9H6L5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RETREG1Q9H6L5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RETREG1Q9H6L5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RETREG1Q9H6L5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RETREG1Q9H6L5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RETREG1Q9H6L5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RETREG1Q9H6L5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RETREG1Q9H6L5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RETREG1Q9H6L5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RETREG1Q9H6L5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RETREG1Q9H6L5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RETREG1Q9H6L5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RETREG1Q9H6L5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RETREG1Q9H6L5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RETREG1Q9H6L5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RETREG1Q9H6L5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RETREG1Q9H6L5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RETREG1Q9H6L5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RETREG1Q9H6L5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RETREG1Q9H6L5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RETREG1Q9H6L5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RETREG1Q9H6L5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RETREG1Q9H6L5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RETREG1Q9H6L5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RETREG1Q9H6L5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RETREG1Q9H6L5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RETREG1Q9H6L5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RETREG1Q9H6L5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RETREG1Q9H6L5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RETREG1Q9H6L5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RETREG1Q9H6L5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RETREG1Q9H6L5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RETREG1Q9H6L5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RETREG1Q9H6L5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RETREG1Q9H6L5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RETREG1Q9H6L5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RETREG1Q9H6L5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RETREG1Q9H6L5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RETREG1Q9H6L5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RETREG1Q9H6L5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RETREG1Q9H6L5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RETREG1Q9H6L5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RETREG1Q9H6L5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RETREG1Q9H6L5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RETREG1Q9H6L5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RETREG1Q9H6L5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RETREG1Q9H6L5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RETREG1Q9H6L5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RETREG1Q9H6L5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RETREG1Q9H6L5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RETREG1Q9H6L5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RETREG1Q9H6L5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RETREG1Q9H6L5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RETREG1Q9H6L5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RETREG1Q9H6L5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RETREG1Q9H6L5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RETREG1Q9H6L5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RETREG1Q9H6L5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RETREG1Q9H6L5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RETREG1Q9H6L5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RETREG1Q9H6L5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RETREG1Q9H6L5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RETREG1Q9H6L5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RETREG1Q9H6L5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms