Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3K2

GHITM, Growth hormone-inducible transmembrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GHITMQ9H3K2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GHITMQ9H3K2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GHITMQ9H3K2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GHITMQ9H3K2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GHITMQ9H3K2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GHITMQ9H3K2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GHITMQ9H3K2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GHITMQ9H3K2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GHITMQ9H3K2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GHITMQ9H3K2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GHITMQ9H3K2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GHITMQ9H3K2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GHITMQ9H3K2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GHITMQ9H3K2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GHITMQ9H3K2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GHITMQ9H3K2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GHITMQ9H3K2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GHITMQ9H3K2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GHITMQ9H3K2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GHITMQ9H3K2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GHITMQ9H3K2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GHITMQ9H3K2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GHITMQ9H3K2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GHITMQ9H3K2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GHITMQ9H3K2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GHITMQ9H3K2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GHITMQ9H3K2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GHITMQ9H3K2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GHITMQ9H3K2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GHITMQ9H3K2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GHITMQ9H3K2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GHITMQ9H3K2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GHITMQ9H3K2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GHITMQ9H3K2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GHITMQ9H3K2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GHITMQ9H3K2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GHITMQ9H3K2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GHITMQ9H3K2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GHITMQ9H3K2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GHITMQ9H3K2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GHITMQ9H3K2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GHITMQ9H3K2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GHITMQ9H3K2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GHITMQ9H3K2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GHITMQ9H3K2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GHITMQ9H3K2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GHITMQ9H3K2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GHITMQ9H3K2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GHITMQ9H3K2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GHITMQ9H3K2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GHITMQ9H3K2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GHITMQ9H3K2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GHITMQ9H3K2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GHITMQ9H3K2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GHITMQ9H3K2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GHITMQ9H3K2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GHITMQ9H3K2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GHITMQ9H3K2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GHITMQ9H3K2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GHITMQ9H3K2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GHITMQ9H3K2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GHITMQ9H3K2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GHITMQ9H3K2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GHITMQ9H3K2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GHITMQ9H3K2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GHITMQ9H3K2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GHITMQ9H3K2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GHITMQ9H3K2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GHITMQ9H3K2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GHITMQ9H3K2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GHITMQ9H3K2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GHITMQ9H3K2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GHITMQ9H3K2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GHITMQ9H3K2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GHITMQ9H3K2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GHITMQ9H3K2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GHITMQ9H3K2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GHITMQ9H3K2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GHITMQ9H3K2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GHITMQ9H3K2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GHITMQ9H3K2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GHITMQ9H3K2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GHITMQ9H3K2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GHITMQ9H3K2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GHITMQ9H3K2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GHITMQ9H3K2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GHITMQ9H3K2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GHITMQ9H3K2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GHITMQ9H3K2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GHITMQ9H3K2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GHITMQ9H3K2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GHITMQ9H3K2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GHITMQ9H3K2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GHITMQ9H3K2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GHITMQ9H3K2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GHITMQ9H3K2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GHITMQ9H3K2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GHITMQ9H3K2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GHITMQ9H3K2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GHITMQ9H3K2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms