Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
USP44Q9H0E7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
USP44Q9H0E7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
USP44Q9H0E7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
USP44Q9H0E7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
USP44Q9H0E7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
USP44Q9H0E7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
USP44Q9H0E7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
USP44Q9H0E7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
USP44Q9H0E7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
USP44Q9H0E7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
USP44Q9H0E7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
USP44Q9H0E7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
USP44Q9H0E7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
USP44Q9H0E7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
USP44Q9H0E7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
USP44Q9H0E7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
USP44Q9H0E7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
USP44Q9H0E7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
USP44Q9H0E7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
USP44Q9H0E7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
USP44Q9H0E7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
USP44Q9H0E7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
USP44Q9H0E7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
USP44Q9H0E7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
USP44Q9H0E7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
USP44Q9H0E7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
USP44Q9H0E7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
USP44Q9H0E7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
USP44Q9H0E7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
USP44Q9H0E7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
USP44Q9H0E7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
USP44Q9H0E7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
USP44Q9H0E7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
USP44Q9H0E7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
USP44Q9H0E7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
USP44Q9H0E7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
USP44Q9H0E7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
USP44Q9H0E7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
USP44Q9H0E7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
USP44Q9H0E7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
USP44Q9H0E7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
USP44Q9H0E7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
USP44Q9H0E7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
USP44Q9H0E7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
USP44Q9H0E7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
USP44Q9H0E7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
USP44Q9H0E7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
USP44Q9H0E7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
USP44Q9H0E7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
USP44Q9H0E7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
USP44Q9H0E7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
USP44Q9H0E7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP44Q9H0E7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP44Q9H0E7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
USP44Q9H0E7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
USP44Q9H0E7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
USP44Q9H0E7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
USP44Q9H0E7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP44Q9H0E7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP44Q9H0E7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP44Q9H0E7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
USP44Q9H0E7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
USP44Q9H0E7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
USP44Q9H0E7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
USP44Q9H0E7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
USP44Q9H0E7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP44Q9H0E7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP44Q9H0E7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP44Q9H0E7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
USP44Q9H0E7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
USP44Q9H0E7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP44Q9H0E7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP44Q9H0E7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP44Q9H0E7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP44Q9H0E7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
USP44Q9H0E7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
USP44Q9H0E7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
USP44Q9H0E7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP44Q9H0E7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP44Q9H0E7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP44Q9H0E7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
USP44Q9H0E7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
USP44Q9H0E7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
USP44Q9H0E7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP44Q9H0E7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP44Q9H0E7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP44Q9H0E7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP44Q9H0E7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP44Q9H0E7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP44Q9H0E7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP44Q9H0E7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP44Q9H0E7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP44Q9H0E7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
USP44Q9H0E7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP44Q9H0E7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP44Q9H0E7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP44Q9H0E7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP44Q9H0E7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP44Q9H0E7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms