Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN6

SLC6A16, Orphan sodium- and chloride-dependent neurotransmitter transporter NTT5, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A16Q9GZN6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC6A16Q9GZN6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC6A16Q9GZN6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC6A16Q9GZN6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC6A16Q9GZN6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC6A16Q9GZN6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC6A16Q9GZN6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC6A16Q9GZN6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC6A16Q9GZN6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC6A16Q9GZN6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC6A16Q9GZN6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC6A16Q9GZN6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A16Q9GZN6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A16Q9GZN6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A16Q9GZN6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A16Q9GZN6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A16Q9GZN6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC6A16Q9GZN6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC6A16Q9GZN6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC6A16Q9GZN6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC6A16Q9GZN6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC6A16Q9GZN6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC6A16Q9GZN6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC6A16Q9GZN6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC6A16Q9GZN6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC6A16Q9GZN6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A16Q9GZN6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A16Q9GZN6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A16Q9GZN6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC6A16Q9GZN6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A16Q9GZN6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A16Q9GZN6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A16Q9GZN6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A16Q9GZN6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC6A16Q9GZN6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC6A16Q9GZN6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC6A16Q9GZN6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A16Q9GZN6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A16Q9GZN6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A16Q9GZN6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A16Q9GZN6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC6A16Q9GZN6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC6A16Q9GZN6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC6A16Q9GZN6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC6A16Q9GZN6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC6A16Q9GZN6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC6A16Q9GZN6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC6A16Q9GZN6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC6A16Q9GZN6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC6A16Q9GZN6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC6A16Q9GZN6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC6A16Q9GZN6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC6A16Q9GZN6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC6A16Q9GZN6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC6A16Q9GZN6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC6A16Q9GZN6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A16Q9GZN6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A16Q9GZN6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A16Q9GZN6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A16Q9GZN6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC6A16Q9GZN6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC6A16Q9GZN6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC6A16Q9GZN6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A16Q9GZN6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A16Q9GZN6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A16Q9GZN6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC6A16Q9GZN6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC6A16Q9GZN6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC6A16Q9GZN6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC6A16Q9GZN6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC6A16Q9GZN6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC6A16Q9GZN6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC6A16Q9GZN6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A16Q9GZN6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms