Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ71

PITPNM3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM3Q9BZ71 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PITPNM3Q9BZ71 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PITPNM3Q9BZ71 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PITPNM3Q9BZ71 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PITPNM3Q9BZ71 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PITPNM3Q9BZ71 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PITPNM3Q9BZ71 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PITPNM3Q9BZ71 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PITPNM3Q9BZ71 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PITPNM3Q9BZ71 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PITPNM3Q9BZ71 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PITPNM3Q9BZ71 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PITPNM3Q9BZ71 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PITPNM3Q9BZ71 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PITPNM3Q9BZ71 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PITPNM3Q9BZ71 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PITPNM3Q9BZ71 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PITPNM3Q9BZ71 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PITPNM3Q9BZ71 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PITPNM3Q9BZ71 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PITPNM3Q9BZ71 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PITPNM3Q9BZ71 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PITPNM3Q9BZ71 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PITPNM3Q9BZ71 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PITPNM3Q9BZ71 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PITPNM3Q9BZ71 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PITPNM3Q9BZ71 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PITPNM3Q9BZ71 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PITPNM3Q9BZ71 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PITPNM3Q9BZ71 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PITPNM3Q9BZ71 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PITPNM3Q9BZ71 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PITPNM3Q9BZ71 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PITPNM3Q9BZ71 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PITPNM3Q9BZ71 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PITPNM3Q9BZ71 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PITPNM3Q9BZ71 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PITPNM3Q9BZ71 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PITPNM3Q9BZ71 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PITPNM3Q9BZ71 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PITPNM3Q9BZ71 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PITPNM3Q9BZ71 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PITPNM3Q9BZ71 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PITPNM3Q9BZ71 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PITPNM3Q9BZ71 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PITPNM3Q9BZ71 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PITPNM3Q9BZ71 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PITPNM3Q9BZ71 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PITPNM3Q9BZ71 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PITPNM3Q9BZ71 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PITPNM3Q9BZ71 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PITPNM3Q9BZ71 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PITPNM3Q9BZ71 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PITPNM3Q9BZ71 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PITPNM3Q9BZ71 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PITPNM3Q9BZ71 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PITPNM3Q9BZ71 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PITPNM3Q9BZ71 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PITPNM3Q9BZ71 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PITPNM3Q9BZ71 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PITPNM3Q9BZ71 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PITPNM3Q9BZ71 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PITPNM3Q9BZ71 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PITPNM3Q9BZ71 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PITPNM3Q9BZ71 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PITPNM3Q9BZ71 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PITPNM3Q9BZ71 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PITPNM3Q9BZ71 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PITPNM3Q9BZ71 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PITPNM3Q9BZ71 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PITPNM3Q9BZ71 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PITPNM3Q9BZ71 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PITPNM3Q9BZ71 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PITPNM3Q9BZ71 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PITPNM3Q9BZ71 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PITPNM3Q9BZ71 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PITPNM3Q9BZ71 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PITPNM3Q9BZ71 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PITPNM3Q9BZ71 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PITPNM3Q9BZ71 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PITPNM3Q9BZ71 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PITPNM3Q9BZ71 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PITPNM3Q9BZ71 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PITPNM3Q9BZ71 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PITPNM3Q9BZ71 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PITPNM3Q9BZ71 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PITPNM3Q9BZ71 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PITPNM3Q9BZ71 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PITPNM3Q9BZ71 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PITPNM3Q9BZ71 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PITPNM3Q9BZ71 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PITPNM3Q9BZ71 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PITPNM3Q9BZ71 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PITPNM3Q9BZ71 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PITPNM3Q9BZ71 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PITPNM3Q9BZ71 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PITPNM3Q9BZ71 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PITPNM3Q9BZ71 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PITPNM3Q9BZ71 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PITPNM3Q9BZ71 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms