Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRRTQ9BXP5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRRTQ9BXP5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRRTQ9BXP5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRRTQ9BXP5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRRTQ9BXP5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRRTQ9BXP5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRRTQ9BXP5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRRTQ9BXP5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRRTQ9BXP5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRRTQ9BXP5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRRTQ9BXP5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRRTQ9BXP5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRRTQ9BXP5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SRRTQ9BXP5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRRTQ9BXP5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRRTQ9BXP5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRRTQ9BXP5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRRTQ9BXP5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRRTQ9BXP5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRRTQ9BXP5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRRTQ9BXP5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRRTQ9BXP5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRRTQ9BXP5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRRTQ9BXP5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRRTQ9BXP5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRRTQ9BXP5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRRTQ9BXP5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRRTQ9BXP5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRRTQ9BXP5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRRTQ9BXP5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRRTQ9BXP5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRRTQ9BXP5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRRTQ9BXP5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRRTQ9BXP5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SRRTQ9BXP5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRRTQ9BXP5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRRTQ9BXP5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRRTQ9BXP5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRRTQ9BXP5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRRTQ9BXP5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRRTQ9BXP5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SRRTQ9BXP5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRRTQ9BXP5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRRTQ9BXP5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRRTQ9BXP5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRRTQ9BXP5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRRTQ9BXP5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRRTQ9BXP5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRRTQ9BXP5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRRTQ9BXP5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRRTQ9BXP5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRRTQ9BXP5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRRTQ9BXP5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRRTQ9BXP5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRRTQ9BXP5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRRTQ9BXP5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRRTQ9BXP5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRRTQ9BXP5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRRTQ9BXP5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRRTQ9BXP5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRRTQ9BXP5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SRRTQ9BXP5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRRTQ9BXP5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRRTQ9BXP5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRRTQ9BXP5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SRRTQ9BXP5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SRRTQ9BXP5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SRRTQ9BXP5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRRTQ9BXP5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRRTQ9BXP5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRRTQ9BXP5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SRRTQ9BXP5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRRTQ9BXP5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRRTQ9BXP5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRRTQ9BXP5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRRTQ9BXP5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRRTQ9BXP5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRRTQ9BXP5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRRTQ9BXP5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRRTQ9BXP5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRRTQ9BXP5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRRTQ9BXP5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRRTQ9BXP5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRRTQ9BXP5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRRTQ9BXP5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRRTQ9BXP5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRRTQ9BXP5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRRTQ9BXP5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SRRTQ9BXP5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SRRTQ9BXP5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRRTQ9BXP5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRRTQ9BXP5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRRTQ9BXP5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRRTQ9BXP5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRRTQ9BXP5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRRTQ9BXP5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRRTQ9BXP5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRRTQ9BXP5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRRTQ9BXP5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms