Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KATNB1Q9BVA0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KATNB1Q9BVA0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KATNB1Q9BVA0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KATNB1Q9BVA0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KATNB1Q9BVA0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KATNB1Q9BVA0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KATNB1Q9BVA0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KATNB1Q9BVA0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KATNB1Q9BVA0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KATNB1Q9BVA0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KATNB1Q9BVA0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KATNB1Q9BVA0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KATNB1Q9BVA0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KATNB1Q9BVA0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KATNB1Q9BVA0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KATNB1Q9BVA0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KATNB1Q9BVA0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KATNB1Q9BVA0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KATNB1Q9BVA0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KATNB1Q9BVA0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KATNB1Q9BVA0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KATNB1Q9BVA0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KATNB1Q9BVA0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KATNB1Q9BVA0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KATNB1Q9BVA0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KATNB1Q9BVA0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KATNB1Q9BVA0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KATNB1Q9BVA0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KATNB1Q9BVA0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KATNB1Q9BVA0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KATNB1Q9BVA0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KATNB1Q9BVA0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KATNB1Q9BVA0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KATNB1Q9BVA0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KATNB1Q9BVA0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KATNB1Q9BVA0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KATNB1Q9BVA0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KATNB1Q9BVA0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KATNB1Q9BVA0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms