Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV35

SLC25A23, Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-3, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A23Q9BV35 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC25A23Q9BV35 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC25A23Q9BV35 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC25A23Q9BV35 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC25A23Q9BV35 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC25A23Q9BV35 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC25A23Q9BV35 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC25A23Q9BV35 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC25A23Q9BV35 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC25A23Q9BV35 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC25A23Q9BV35 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC25A23Q9BV35 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC25A23Q9BV35 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC25A23Q9BV35 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC25A23Q9BV35 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC25A23Q9BV35 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC25A23Q9BV35 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC25A23Q9BV35 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC25A23Q9BV35 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC25A23Q9BV35 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC25A23Q9BV35 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC25A23Q9BV35 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC25A23Q9BV35 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC25A23Q9BV35 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC25A23Q9BV35 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC25A23Q9BV35 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC25A23Q9BV35 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC25A23Q9BV35 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC25A23Q9BV35 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC25A23Q9BV35 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC25A23Q9BV35 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC25A23Q9BV35 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC25A23Q9BV35 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC25A23Q9BV35 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC25A23Q9BV35 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC25A23Q9BV35 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC25A23Q9BV35 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC25A23Q9BV35 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC25A23Q9BV35 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC25A23Q9BV35 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC25A23Q9BV35 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC25A23Q9BV35 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC25A23Q9BV35 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC25A23Q9BV35 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC25A23Q9BV35 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC25A23Q9BV35 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC25A23Q9BV35 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC25A23Q9BV35 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC25A23Q9BV35 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC25A23Q9BV35 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC25A23Q9BV35 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC25A23Q9BV35 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC25A23Q9BV35 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC25A23Q9BV35 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC25A23Q9BV35 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC25A23Q9BV35 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC25A23Q9BV35 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC25A23Q9BV35 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC25A23Q9BV35 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC25A23Q9BV35 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC25A23Q9BV35 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC25A23Q9BV35 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC25A23Q9BV35 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC25A23Q9BV35 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC25A23Q9BV35 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC25A23Q9BV35 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC25A23Q9BV35 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC25A23Q9BV35 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC25A23Q9BV35 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC25A23Q9BV35 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC25A23Q9BV35 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC25A23Q9BV35 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC25A23Q9BV35 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC25A23Q9BV35 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC25A23Q9BV35 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC25A23Q9BV35 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC25A23Q9BV35 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC25A23Q9BV35 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC25A23Q9BV35 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC25A23Q9BV35 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC25A23Q9BV35 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC25A23Q9BV35 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC25A23Q9BV35 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC25A23Q9BV35 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC25A23Q9BV35 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC25A23Q9BV35 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC25A23Q9BV35 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC25A23Q9BV35 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC25A23Q9BV35 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC25A23Q9BV35 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC25A23Q9BV35 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC25A23Q9BV35 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC25A23Q9BV35 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC25A23Q9BV35 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC25A23Q9BV35 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC25A23Q9BV35 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC25A23Q9BV35 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms