Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR10

SPATA25, Spermatogenesis-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA25Q9BR10 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPATA25Q9BR10 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPATA25Q9BR10 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPATA25Q9BR10 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPATA25Q9BR10 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPATA25Q9BR10 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPATA25Q9BR10 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPATA25Q9BR10 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPATA25Q9BR10 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPATA25Q9BR10 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPATA25Q9BR10 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPATA25Q9BR10 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPATA25Q9BR10 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPATA25Q9BR10 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPATA25Q9BR10 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPATA25Q9BR10 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SPATA25Q9BR10 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPATA25Q9BR10 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPATA25Q9BR10 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPATA25Q9BR10 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPATA25Q9BR10 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPATA25Q9BR10 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPATA25Q9BR10 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPATA25Q9BR10 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPATA25Q9BR10 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPATA25Q9BR10 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPATA25Q9BR10 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPATA25Q9BR10 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPATA25Q9BR10 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPATA25Q9BR10 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPATA25Q9BR10 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPATA25Q9BR10 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPATA25Q9BR10 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPATA25Q9BR10 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPATA25Q9BR10 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPATA25Q9BR10 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPATA25Q9BR10 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms