Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HINFPQ9BQA5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HINFPQ9BQA5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HINFPQ9BQA5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HINFPQ9BQA5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HINFPQ9BQA5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HINFPQ9BQA5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HINFPQ9BQA5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HINFPQ9BQA5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HINFPQ9BQA5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HINFPQ9BQA5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HINFPQ9BQA5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HINFPQ9BQA5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HINFPQ9BQA5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HINFPQ9BQA5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HINFPQ9BQA5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HINFPQ9BQA5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HINFPQ9BQA5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HINFPQ9BQA5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HINFPQ9BQA5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HINFPQ9BQA5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HINFPQ9BQA5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HINFPQ9BQA5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HINFPQ9BQA5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HINFPQ9BQA5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HINFPQ9BQA5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HINFPQ9BQA5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HINFPQ9BQA5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HINFPQ9BQA5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HINFPQ9BQA5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HINFPQ9BQA5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HINFPQ9BQA5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HINFPQ9BQA5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HINFPQ9BQA5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HINFPQ9BQA5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HINFPQ9BQA5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HINFPQ9BQA5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HINFPQ9BQA5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HINFPQ9BQA5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HINFPQ9BQA5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
HINFPQ9BQA5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HINFPQ9BQA5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HINFPQ9BQA5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HINFPQ9BQA5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HINFPQ9BQA5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HINFPQ9BQA5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HINFPQ9BQA5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HINFPQ9BQA5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HINFPQ9BQA5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HINFPQ9BQA5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HINFPQ9BQA5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
HINFPQ9BQA5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HINFPQ9BQA5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HINFPQ9BQA5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HINFPQ9BQA5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HINFPQ9BQA5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HINFPQ9BQA5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HINFPQ9BQA5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HINFPQ9BQA5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HINFPQ9BQA5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HINFPQ9BQA5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HINFPQ9BQA5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HINFPQ9BQA5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HINFPQ9BQA5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HINFPQ9BQA5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
HINFPQ9BQA5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HINFPQ9BQA5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HINFPQ9BQA5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HINFPQ9BQA5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HINFPQ9BQA5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HINFPQ9BQA5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HINFPQ9BQA5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HINFPQ9BQA5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HINFPQ9BQA5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HINFPQ9BQA5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HINFPQ9BQA5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HINFPQ9BQA5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HINFPQ9BQA5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HINFPQ9BQA5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HINFPQ9BQA5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HINFPQ9BQA5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HINFPQ9BQA5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HINFPQ9BQA5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HINFPQ9BQA5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HINFPQ9BQA5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HINFPQ9BQA5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HINFPQ9BQA5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HINFPQ9BQA5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HINFPQ9BQA5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HINFPQ9BQA5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HINFPQ9BQA5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HINFPQ9BQA5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HINFPQ9BQA5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HINFPQ9BQA5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HINFPQ9BQA5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HINFPQ9BQA5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HINFPQ9BQA5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HINFPQ9BQA5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HINFPQ9BQA5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HINFPQ9BQA5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms